| 基于 EST 和 GSS 序列的茶树 miRNA 及其靶基因数据挖掘 |
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| 引用本文： | 张 玥,熊 飞,胡雲飞,柯子星,房婉萍. 基于 EST 和 GSS 序列的茶树 miRNA 及其靶基因数据挖掘[J]. 热带作物学报, 2018, 39(10): 1999-2006 |
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| 作者姓名： | 张 玥 熊 飞 胡雲飞 柯子星 房婉萍 |
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| 作者单位： | 1. 福建农林大学安溪茶学院，福建福州 350002；2. 南京农业大学茶叶科学研究所，江苏南京 210095 |
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| 摘 要： | microRNA（miRNA）是一类长 19~24 个碱基的小分子内源性非编码单链 RNA，通过介导靶基因的裂解或抑 制靶基因的翻译，在植物的发育、新陈代谢、应激响应等方面起着重要的调控作用，在进化上具有高度的保守性。据 此本研究以 miRBase 注册的全部成熟植物 miRNA 序列为探针，基于 NCBI 数据库中茶树表达序列标签（EST）和基因 组勘测序列（GSS）进行同源搜索和 miRNA 二级结构分析，总共发现 7 条茶树的 miRNA，分属于 6 个不同的 miRNA 家族。通过靶基因的预测分析表明，这些 miRNA 可能调节 28 种靶标基因，功能涉及新陈代谢、生长发育、胁迫应答 及转录，为茶树 miRNA 的试验鉴定和功能研究提供更详细精确的范围，为进一步探究茶树 miRNA 的调控机理奠定 基础。
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| 关 键 词： | microRNA 茶树 EST GSS 靶基因 |
Prediction of the MicroRNAs and Their Targets in Tea Plant (Camellia sinensis L.) Based on EST and GSS Sequences |
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| ZHANG Yue,XIONG Fei,HU Yunfei,KO Tzuhsing,FANG Wanping. Prediction of the MicroRNAs and Their Targets in Tea Plant (Camellia sinensis L.) Based on EST and GSS Sequences[J]. Chinese Journal of Tropical Crops, 2018, 39(10): 1999-2006 |
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| Authors: | ZHANG Yue XIONG Fei HU Yunfei KO Tzuhsing FANG Wanping |
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| Affiliation: | 1. Anxi College of Tea Science, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou, Fujian 350002, China; 2. Tea Research Institute, Nanjing Agricultural University, Nanjing, Jiangsu 210095, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | microRNA tea plant EST GSS target genes |
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