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森林草莓6mA甲基转移酶基因鉴定及功能分析
引用本文:徐 昇,张 鑫,刘德才,顾婷婷.森林草莓6mA甲基转移酶基因鉴定及功能分析[J].园艺学报,2020,47(11):2194-2206.
作者姓名:徐 昇  张 鑫  刘德才  顾婷婷
作者单位:南京农业大学园艺学院,南京 210095
基金项目:国家自然科学基金项目(31672123):江苏高校品牌专业建设工程资助项目(PPZY2015B156)
摘    要:通过生物信息学手段,鉴定出森林草莓(Fragaria vesca)基因组中两类可能的6mA甲基转移酶基因5个(3个MT-A70、2个DAMT基因)。对细菌、真菌、动物和植物中的6mA甲基转移酶基因的系统进化分析及染色体定位表明,森林草莓MT-A70基因可分为3个亚家族,且在动、植物分化前就已经存在:两个DAMT基因由物种特异的串联重复产生,且结构变化快,推测其在进化历程中功能发生了分化。转录组数据及实时定量荧光PCR分析显示,各个基因均具有时空表达特异性和非生物胁迫响应。其中1个DAMT基因表达量在果实中较高且随果实成熟上调,推测可能参与调控果实成熟。此外,这5个基因在冷胁迫下表达水平有不同程度下调:而在热胁迫下各基因表达量变化显著不同。由此推测6mA甲基转移酶基因可能参与了森林草莓的生长发育和对冷、热胁迫的响应。

关 键 词:森林草莓  N6–腺嘌呤甲基化(6mA)  N6–腺嘌呤甲基转移酶  系统进化  逆境胁迫  

Identification and Functional Analysis of N6-Adenine Methylation(6mA)Methyltransferase Genes in Fragaria vesca
XU Sheng,ZHANG Xin,LIU Decai,GU Tingting.Identification and Functional Analysis of N6-Adenine Methylation(6mA)Methyltransferase Genes in Fragaria vesca[J].Acta Horticulturae Sinica,2020,47(11):2194-2206.
Authors:XU Sheng  ZHANG Xin  LIU Decai  GU Tingting
Institution:College of Horticulture,Nanjing Agricultural University,Nanjing 210095,China
Abstract:
Keywords:Fragaria vesca  N6-adenine methylation  N6-adenine DNA methyltransferase genes  phylogenetic evolution  abiotic stress  
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