甜玉米种质资源种子性状全基因组关联分析

粒长、粒宽、粒厚、百粒质量是影响玉米籽粒产量的重要性状,本研究主要统计分析了100份甜玉米种质资源的粒长、粒宽、粒厚和百粒质量等4个种子性状,并利用37297个单核苷酸多态性(SNP)标记位点关联分析了控制甜玉米种子性状的重要位点.结果表明,100份甜玉米种质资源种子性状具有丰富的遗传多样性,性状变异幅度比较大,其中粒长为4.65～10.43 mm,粒宽为5.13～9.42 mm,粒厚为2.04～7.50 mm,百粒质量为4.51～20.09 g;表型变异分析发现,百粒质量的变异系数最大,为32.60％,粒宽的变异系数最小,为10.61％,且4个籽粒性状的频率分布曲线基本符合正态分布.相关性分析结果表明,粒长、粒宽、粒厚与百粒质量呈极显著正相关,粒长与粒厚呈极显著负相关.全基因组关联分析共检测到控制4个种子性状的75个SNP标记位点,其中有17个SNP标记位点与粒长性状有关,24个SNP标记位点与粒宽性状有关,11个SNP标记位点与粒厚性状有关,23个SNP标记位点与百粒质量性状有关.

Genome-wide association study of grain traits of sweet maize germplasm resources