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| 花生RGA—SSCP实验条件的优化 | |
| 引用本文： | 漆燕,李双铃,袁美,王辉,任艳,石延茂,崔富华,李加纳,禹山林.花生RGA—SSCP实验条件的优化[J].山东农业科学,2010(6):1-4,9. |
| 作者姓名： | 漆燕 李双铃 袁美 王辉 任艳 石延茂 崔富华 李加纳 禹山林 |
| 作者单位： | 1. 山东省花生研究所/国家花生工程技术研究中心,山东,青岛,266100;南充市农业科学研究所,四川,南充,637000;西南大学农学与生物科技学院,重庆,400716 2. 山东省花生研究所/国家花生工程技术研究中心,山东,青岛,266100 3. 南充市农业科学研究所,四川,南充,637000 4. 西南大学农学与生物科技学院,重庆,400716 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金，青岛科技发展计划，国家"863"计划，山东省农业科学院创新基金 |
| 摘 要： | 单链构象多态性（SSCP）技术是一种简便、灵敏的多态性检测方法，近年在植物研究中得到了较多应用。为了检测花生品种间抗病基因同源序列（rtgA）的单核苷酸差异，对影响花生RGA—SSCP的电泳温度、电压、胶浓度、交联度、变性剂等因素进行了优化。结果表明，碱变性后的PCR产物（PCR产物与碱变性剂比例1：2）在不加甘油的8％非变性聚丙烯酰胺凝胶（交联度为29：1）、1×TBE电泳缓冲液、恒温4℃和600V条件下电泳5h为最佳优化组合。用上述优化方法分析了抗、感北方根结线虫病的亲本及F2群体部分单株，获得了电泳条带细而清晰的SSCP图。该体系的建立对RGA—SSCP标记用于花生基因定位、遗传图谱构建、标记辅助选择等具有重要意义。 |
| 关 键 词： | 花生 RGA—SSCP 优化 分子标记 |
Optimization of RGA-SSCP System for Peanut |
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| QI Yan,LI Shuang-ling,YUAN Mei,WANG Hui,REN Yan,SHI Yan-mao,CUI Fu-hua,LI Jia-na,YU Shan-lin.Optimization of RGA-SSCP System for Peanut[J].Shandong Agricultural Sciences,2010(6):1-4,9. | |
| Authors: | QI Yan LI Shuang-ling YUAN Mei WANG Hui REN Yan SHI Yan-mao CUI Fu-hua LI Jia-na YU Shan-lin |
| Institution: | QI Yan1,2,3,LI Shuang-ling1,YUAN Mei1,WANG Hui1,REN Yan1,SHI Yan-mao2,CUI Fu-hua2,LI Jia-na3,YU Shan-lin1(1.Sh,ong Peanut Research Institute/ National Center for Peanut Engineering , Technology,Qingdao 266100,China,2.Nanchong Institute of Agricultural Sciences,Nanchong 637000,3.College of Agronomy , Biotechnology,Southwest University,Chongqing 400716,China) |
| Abstract: | Single strand conformation polymorphism(SSCP) is a quite simple and sensitive method for polymorphism detection,which has been widely used in plant research recently.In order to develop an SSCP analysis method for detecting the single nucleotide changes of resistant gene analogs(RGA) in peanut,the optimization trials were performed in temperature,voltage,gum concentration,crosslinking degree,denaturant and so on.The best separation of SSCP bands of RGA products was obtained with 8% native polyacrylamide gel... |
| Keywords: | RGA-SSCP |
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