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甘蔗杆状病毒基因组片段整合入杂种甘蔗基因组的证据
引用本文:蔡艳清,许东林,周国辉.甘蔗杆状病毒基因组片段整合入杂种甘蔗基因组的证据[J].华南农业大学学报,2009,30(4).
作者姓名:蔡艳清  许东林  周国辉
作者单位:华南农业大学,资源环境学院,植物病毒研究室,广东,广州,510642
基金项目:广东省科技计划项目,广东省自然科学基金 
摘    要:为研究甘蔗杆状病毒Sugarcane bacilliform virus(SCBV)的基因组片段是否整合进杂种甘蔗Saccharum inter-specific hybrids基因组,以采自广西甘蔗研究所的1株杂种甘蔗植株叶片总DNA为模板,根据已报道的甘蔗杆状病毒基因组序列设计多条特异引物.经PCR扩增、产物克隆及序列分析,获得1个全长为5 364 bp的核苷酸序列.该序列具有SCBV基因组结构特征,含有2个完整的ORF,与GenBank中已报道的2个SCBV分离物之间的核苷酸及氨基酸序列同一性均大于70%,但该序列与完整的SCBV基因组全序列相比,不具备完全的ORF3,缺失了对病毒复制过程极为重要的功能性基因RNase H的序列区段.通过Southern-blot杂交分析,初步推测其为一段整合入杂种甘蔗基因组中的SCBV基因组序列.

关 键 词:甘蔗杆状病毒  杂种甘蔗  病毒同源序列  序列分析

Evidence of Sugarcane bacilliform virus DNA Fragment Integrated into the Saccharum Inter-Specific Hybrids Genome
CAI Yan-qing,XU Dong-lin,ZHOU Guo-hui.Evidence of Sugarcane bacilliform virus DNA Fragment Integrated into the Saccharum Inter-Specific Hybrids Genome[J].Journal of South China Agricultural University,2009,30(4).
Authors:CAI Yan-qing  XU Dong-lin  ZHOU Guo-hui
Abstract:
Keywords:
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