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感染北京地区大葱的胡葱黄条病毒外壳蛋白基因的克隆及分析
引用本文:田保华,王永勤,王婵.感染北京地区大葱的胡葱黄条病毒外壳蛋白基因的克隆及分析[J].中国蔬菜,2012,1(16):36-41.
作者姓名:田保华  王永勤  王婵
作者单位:1.北京市农林科学院蔬菜研究中心,北京 100097,2山西大学生命科学学院,山西太原 030005
基金项目:国家自然科学基金项目(31071794);农业部“948”计划项目(2011-Z61);北京市农林科学院科技创新能力建设专项(KJCX201101010)
摘    要:以感染胡葱黄条病毒(Shallot yellow stripe virus,SYSV)的大葱为材料,通过反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)获得包含SYSV-CP全部编码序列、NIb蛋白基因5′端的部分序列和3′UTR的2个基因片段,分别命名为SYSV-CP1和SYSV-CP2,它们的编码区碱基数均为774 bp,均编码258个氨基酸|在该编码区内存在2个碱基的差异,编码的蛋白存在1个氨基酸的差异。系统进化树分析表明:SYSV分离物可以区分为两个主要群体,SYSV-CP1和SYSV-CP2位于第Ⅱ组内,它们与来自浙江的SYSV的分离物亲缘关系最近,表现出一定的地理分布相关性。

关 键 词:大葱  胡葱黄条病毒  外壳蛋白基因  克隆  

Cloning and Sequence Analysis of CP Gene of Shallot Yellow Stripe Virus Isolated from Welsh Onion in Beijing Area
TIAN Bao-hua , WANG Yong-qin , WANG Chan.Cloning and Sequence Analysis of CP Gene of Shallot Yellow Stripe Virus Isolated from Welsh Onion in Beijing Area[J].China Vegetables,2012,1(16):36-41.
Authors:TIAN Bao-hua  WANG Yong-qin  WANG Chan
Institution:1.Beijing Vegetable Research Center,Beijing Academy of Agriculture and Forestry Sciences,Beijing 100097,China|2School of Life Science,Shanxi University,Taiyuan 030005,Shanxi,China
Abstract:
Keywords:Shallot yellow stripe virus(SYSV)  Coat protein gene  Cloning
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