五指山小型猪PDCD10 cDNA的克隆及生物信息学分析 |
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引用本文: | 杜丽,荣辉,张珈宁,侯冠彧,周汉林,郭莳雨,贾晓哓,史巧芸,王凤阳.五指山小型猪PDCD10 cDNA的克隆及生物信息学分析[J].黑龙江畜牧兽医,2013(7):40-42,174,175. |
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作者姓名: | 杜丽 荣辉 张珈宁 侯冠彧 周汉林 郭莳雨 贾晓哓 史巧芸 王凤阳 |
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作者单位: | 海南大学农学院海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室/海口市动物基因工程重点实验室;中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所 |
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基金项目: | “十二五”农村领域国家科技计划课题项目(2011AA100302);中央级公益性科研院所基本科研业务费专项项目(PZS-068) |
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摘 要: | 为了克隆五指山小型猪程序性死亡因子10(PDCD10)cDNA基因并进行生物信息学分析,试验以构建的五指山小型猪外周血白细胞cDNA文库为材料,采用菌落PCR的方法,克隆得到PDCD10全长cDNA序列,运用生物信息学软件分析其核苷酸序列并预测其编码蛋白的理化性质及二级结构等。结果表明:经比对分析发现,五指山小型猪PDCD10基因的核苷酸序列及其氨基酸序列与人、小鼠、牛、鸡、非洲爪蟾、斑马鱼、黑腹果蝇等具有较高的相似性。生物信息学分析结果表明,该cDNA序列全长1 250 bp,在序列3’末端有终止信号AATAAA。含636 bp(184~819 nt)的开放阅读框,编码212个氨基酸。该蛋白理论等电点(PI)及分子质量分别为7.80和24 701.57 u。
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关 键 词: | 五指山小型猪 cDNA文库 程序性死亡因子10(PDCD10) 克隆 序列分析 |
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