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普通小麦籽粒硬度的全基因组关联分析
作者姓名:胡文静  张晓  刘巧  方正武  高德荣
作者单位:江苏里下河地区农业科学研究所/农业部长江中下游小麦生物学与遗传育种重点实验室,江苏扬州225007;扬州大学/江苏省粮食作物现代产业技术协同创新中心,江苏扬州225009;长江大学农学院,湖北荆州434025;江苏里下河地区农业科学研究所/农业部长江中下游小麦生物学与遗传育种重点实验室,江苏扬州225007;扬州大学/江苏省粮食作物现代产业技术协同创新中心,江苏扬州225009;长江大学农学院,湖北荆州434025
基金项目:国家重点研发计划项目(2016YFD0100502);国家自然科学基金项目(31901544);国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-03-03B,CARS-3-2-11);江苏省现代农业重点项目(BE2017340);江苏省重点研发计划项目(BE2018350);江苏省自然科学基金项目(BK20171279)
摘    要:籽粒硬度是小麦品质评价的重要指标。为挖掘控制小麦籽粒硬度的重要基因/位点,以国内外171个小麦品种组成的自然群体为材料,在4个环境下利用小麦90K SNP芯片对籽粒硬度进行全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS)。171个小麦品种籽粒硬度变异系数为56.59%~66.80%,相关系数为0.88~0.92。GWAS结果表明,共检测到20个与小麦籽粒硬度显著相关的SNPs,其中,14个SNPs(7个位点)在2个及以上环境中能被检测到,分别位于1A、1B、1D、2A、5A和7A染色体上,可解释6.76%~11.79%的表型变异。表型贡献率超过10%的SNPs有4个(3个位点),分布在1D、2A和5A染色体上,其中,1D染色体上的标记wsnp_Ku_c19622_29138795在3个环境中能被检测到,可解释9.08%~11.79%的表型变异;2A染色体上的标记Excalibur_c12675_1789在4个环境中均能被检测到,可解释9.10%~10.86%的表型变异;5A染色体上的标记wsnp_Ra_c24707_34262900和BS00041219_51在2个环境中能被检测到,可解释6.76%~10.35%的表型变异。在所有环境下均与小麦籽粒硬度显著相关的位点有4个,分别位于1A、1B、2A和7A染色体上。

关 键 词:小麦  硬度  90K SNP  全基因组关联分析  品质育种
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