| 中国禽传染性支气管炎病毒的遗传演化及时空传播分析 |
| |
| 引用本文： | 范文胜,刘思伽,邱深本,黄爱芳,王艳,刘敏芳,梅敏敏,陈新亮,韦平,磨美兰.中国禽传染性支气管炎病毒的遗传演化及时空传播分析[J].畜牧兽医学报,2023(6):2543-2554. |
| |
| 作者姓名： | 范文胜 刘思伽 邱深本 黄爱芳 王艳 刘敏芳 梅敏敏 陈新亮 韦平 磨美兰 |
| |
| 作者单位： | 1. 广东科贸职业学院动物科技学院;2. 广西大学动物科学技术学院 |
| |
| 摘 要： | 对从GenBank数据库下载的所有传染性支气管炎病毒(infectious bronchitis virus, IBV)中国分离株之N基因序列进行分析，旨在探索其遗传变异规律和时空传播情况。通过生物信息学软件MEGA 6.0、RDP 4.95、SimPlot 3.5.1、BEAST v1.10.4、jmodeltest 2.1.7、Tracer v1.7.1、TempEst v1.5.1、FigTree v1.4.3以及SpreaD3 v0.9.7等对分离株分别进行系统进化树、基因重组、毒株溯源、种群动态和时空传播分析。系统进化树分析显示，国内IBV毒株分为6种基因型，以LX4型为主；重组分析发现，1株四川分离株N基因存在重组现象；贝叶斯最大分支置信树分析显示，中国IBV最可能起源于20世纪30年代初的辽宁省。贝叶斯谱系地理学分析显示，IBV毒株在国内存在多条传播路径并形成了3个流行中心：东北地区(黑龙江、辽宁和吉林)、华北和华东地区(河北、山东和江苏)以及华南地区(广东、广西),其中，山东最可能成为IBV的毒株来源库。本研究揭示了中国IBV的起源及其传播途径，N基因存在基因重组现象，...
|
| 关 键 词： | 禽传染性支气管炎病毒 遗传变异 基因重组 起源 时空传播 |
|
|
