基于SNP芯片对陆川猪进行遗传多样性与遗传结构分析的研究

陆川猪是我国优良的地方品种，但由于非洲猪瘟的影响导致其养殖量急剧下降，对其进行种质资源保护刻不容缓。本研究旨在通过SNP芯片分析陆川猪遗传结构和遗传多样性，为该群体后续保种策略提供一定的参考。本研究基于269头能繁公母猪SNP芯片信息，分析该群体遗传结构、亲缘关系、家系划分以及近交系数。结果显示，该群体部分个体遗传关系较近，IBS遗传距离在0.09～0.31，平均值为0.25；通过聚类分析和G矩阵结果，将269头陆川猪分为3个家系，分别有9、3、6头公猪，母猪在家系间存在交叉；ROH分析发现该群体平均ROH长度为（503.77±8.89）Mb，主要分布在388～475 Mb,FROH主要分布在0.13～0.23，其平均FROH为0.21±0.004。研究表明，该群体陆川猪家系较少，ROH数量多且较长，近交风险较大，急需引入外源血统丰富其遗传多样性，并根据芯片结果，合理规划配种策略，降低群体近交水平。