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基于16S rRNA测序分析PRRSV感染仔猪肺和肠道中微生物菌群的变化
作者姓名:陆梦琪  杨文杰  李萍  余鹏  董翎  牛晓玉  杨克礼  邹维华  宋卉
作者单位:1. 华中农业大学动物科技学院动物医学院;2. 湖北省农业科学院畜牧兽医研究所;3. 武汉科前生物股份有限公司
基金项目:中央高校基本科研业务费专项资金资助项目(2662020DKPY001);
摘    要:本试验旨在探究猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus, PRRSV)感染对仔猪肺、肠道中的菌群影响以及肺和肠道的组织学变化。试验选取35日龄断奶健康仔猪14头,适应性饲养7 d,随机分为感染组(n=7)和对照组(n=7),感染组仔猪接种2 mL 1×105 TCID50·mL-1PRRSV-JTS毒株病毒液,对照组仔猪接种2 mL DMEM培养基。感染组3头仔猪分别于10、12和19 d死亡,将存活的感染组与对照组仔猪于21 d后处死,并取肺、不同肠段组织样品以及肠道内容物。采用免疫组化染色和HE染色观察肺和肠道组织病理学变化,并基于16S rRNA基因的高通量测序分析仔猪肺和各肠段菌群结构。结果表明,感染组仔猪肺部和肠道均有病毒分布;与对照组仔猪相比,感染组仔猪肺部和肠道均存在明显的炎症反应。微生物组成结构及多样性分析显示,感染组仔猪Chao1、ACE指数在肺中上升,在仔猪各肠段中下降,Shannon、Simpon指数在肺中升高,在...

关 键 词:繁殖与呼吸综合征病毒  肺部微生物  肠道微生物  16S rRNA基因测序
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