| 麝鼠香腺Elovl1基因生物信息学分析及表达研究 |
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| 引用本文： | 雷行,李天峰,李嘉昊,满欣,白素英.麝鼠香腺Elovl1基因生物信息学分析及表达研究[J].中国畜牧兽医,2022,49(4):1201-1212. |
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| 作者姓名： | 雷行 李天峰 李嘉昊 满欣 白素英 |
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| 作者单位： | 1. 东北林业大学野生动物与自然保护地学院, 哈尔滨 150040;2. 国家林业和草原局野生动植物检测中心, 哈尔滨 150040 |
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| 基金项目： | 国家林业和草原局野生动物保护项目(2020070209) |
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| 摘 要： | 【目的】 测定麝鼠超长链脂肪酸延伸酶1(elongase of verylong chain fatty acid 1,Elovl1)基因序列并进行生物信息学分析,探讨其在麝鼠香腺发育和泌香过程中的作用。【方法】 使用TRIzol法提取成年雄性麝鼠香腺总RNA,采用转录组测序技术获得麝鼠香腺Elovl1基因序列并测序;在GenBank数据库中下载啮齿目不同物种的Elovl1基因及其多转录本CDS序列并构建系统进化树;通过在线工具对Elovl1基因编码蛋白的理化性质及结构进行预测与分析;利用实时荧光定量PCR技术分析成年雄性麝鼠香腺发育周期内香腺组织中Elovl1基因的表达水平。【结果】 Elovl1基因在麝鼠香腺中表达2个转录本,能编码2个不同的蛋白,分别由313和279个氨基酸组成。Elovl1基因2个转录本在2~9月末的麝鼠香腺中均有表达,且表达量整体呈先上升后下降的趋势。Elovl1基因编码的2个蛋白均为稳定的亲脂性、非分泌蛋白,具有7个跨膜螺旋区,亚细胞定位均主要位于内质网。在啮齿目动物中,Elovl1基因进化与物种进化基本一致,仓鼠科与鼠科亲缘关系较近,麝鼠与水鼠平亲缘关系最近;同一物种Elovl1基因的不同转录本间相对保守,均按物种聚在一起且置信值普遍较高,旱獭例外。【结论】 Elovl1基因表达规律与麝鼠香腺的发育、萎缩及泌香周期相吻合,提示Elovl1与麝鼠香分泌相关,并参与了香腺细胞发育。
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| 关 键 词： | 麝鼠 香腺 Elovl1基因 表达 生物信息学分析 |
| 收稿时间： | 2021-10-12 |
Bioinformatics Analysis and Expression of Elovl1 Gene in Muskrat Scent Gland |
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| LEI Xing,LI Tianfeng,LI Jiahao,MAN Xin,BAI Suying.Bioinformatics Analysis and Expression of Elovl1 Gene in Muskrat Scent Gland[J].China Animal Husbandry & Veterinary Medicine,2022,49(4):1201-1212. |
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| Authors: | LEI Xing LI Tianfeng LI Jiahao MAN Xin BAI Suying |
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| Institution: | 1. College of Wildlife and Natural Reserve, Northeast Forestry University, Harbin 150040, China;2. Detecting Center of Wildlife, State Forestry and Grassland Administration, Harbin 150040, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | muskrat scent gland Elovl1 gene expression bioinformatics analysis |
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