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莲草直胸跳甲化学感受蛋白CSPs的生物信息学分析
引用本文:王亚茹,王苑馨,胡军,贾栋,高玲玲,马瑞燕.莲草直胸跳甲化学感受蛋白CSPs的生物信息学分析[J].山西农业大学学报(自然科学版),2018(1).
作者姓名:王亚茹  王苑馨  胡军  贾栋  高玲玲  马瑞燕
作者单位:山西农业大学生命科学学院;山西农业大学农学院;澳大利亚联邦科学与工业研究组织;
摘    要:目的]嗅觉在莲草直胸跳甲Agasicles hygrophila专一性识别寄主植物喜旱莲子草Alternanthera philoxeroides中占有重要地位,以莲草直胸跳甲的化学感受蛋白CSPs为研究对象,对其基因结构与功能进行分析。方法]采用生物信息学的方法对莲草直胸跳甲CSPs蛋白的理化性质、信号肽、亚细胞定位、跨膜结构、二级结构、高级结构、多序列比对及系统发育树进行了预测和分析。结果]莲草直胸跳甲CSPs为小分子量水溶性的蛋白质,绝大部分含有信号肽。莲草直胸跳甲CSPs的亚细胞定位绝大部分为胞外,一般不含有跨膜结构。莲草直胸跳甲CSPs的二级结构主要由α螺旋和无规卷曲组成,高级结构由相邻两个半胱氨酸残基之间的二硫键形成4个α螺旋,保持一个疏水的空腔和亲水表面。多序列比对显示莲草直胸跳甲CSPs基本符合昆虫CSPs的保守结构域。系统发育显示莲草直胸跳甲CSPs在种内和种间均具有较高的相似性。莲草直胸跳甲CSPs蛋白具有丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸蛋白激酶的磷酸化位点;含有丝氨酸、苏氨酸蛋白激酶的糖基化位点;含有丝氨酸、苏氨酸、丙氨酸蛋白激酶的乙酰化位点。结论]本文对深入研究莲草直胸跳甲CSPs的嗅觉反应的功能及分子机制奠定了理论基础,有助于阐释外来种的生态安全风险以及昆虫与植物的协同进化。

关 键 词:莲草直胸跳甲  喜旱莲子草  嗅觉  化学感受蛋白  生物信息学分析

Bioinformatic analysis of Agasicles hygrophila CSPs
Abstract:
Keywords:
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