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瓯江彩鲤酪氨酸酶(TYR)基因的选择压力分析
引用本文:古珍珍,杨新鑫,胡建尊,项松平,王剑,王军,徐志彬,王成辉.瓯江彩鲤酪氨酸酶(TYR)基因的选择压力分析[J].上海水产大学学报,2016(3):329-336.
作者姓名:古珍珍  杨新鑫  胡建尊  项松平  王剑  王军  徐志彬  王成辉
作者单位:1. 上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室,上海,201306;2. 浙江省龙泉市水利水电局,浙江龙泉,323700;3. 浙江龙泉省级瓯江彩鲤良种场,浙江龙泉,323700
基金项目:国家自然科学基金(30907725;31372521),上海市科学技术委员会项目(15391900800)
摘    要:酪氨酸酶是生物体黑色素合成的关键限速酶,黑色斑纹是瓯江彩鲤(Cyprinus carpio var.color)体色的主要特点之一.以瓯江彩鲤的5种体色选育系F5为材料,探讨酪氨酸酶基因5个外显子及其在不同体色间的变异特性和承受选择压力的敏感性.结果发现:酪氨酸酶基因外显子1和外显子5的核苷酸变异率最高,选择性位点最多,易承受到选择压力;5个外显子的非同义替换率(dN)与同义替换率(ds)的比值(ω值)均小于1 (0.10~0.67),表明它们均受到净化选择压力;不同体色瓯江彩鲤的酪氨酸酶基因也均受到净化选择压力(ω=0.12 ~0.23).应用PAML软件中的M2a和M8两种模型检测显示:无黑斑体色瓯江彩鲤所受正向选择压力位点数高于有黑斑体色,但不存在显著差异(P>0.05);酪氨酸酶基因中的部分氨基酸位点较易受正向选择压力.研究结果表明:瓯江彩鲤酪氨酸酶基因较保守,主要受净化选择作用,当前的人工选育未对酪氨酸酶基因造成显著的选择压力.

关 键 词:瓯江彩鲤  酪氨酸酶基因  选择压力  遗传变异

Selection pressure analysis of tyrosinase (TYR) gene in Oujiang color common carp (Cyprinus carpio var.color)
Abstract:
Keywords:Cyprinus carpio var  color  tyrosinase gene  selection pressure  genetic variation
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