| 静原鸡AK1基因序列分析及真核表达载体的构建 |
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| 引用本文： | 张娟,虎红红,邓占钊,母童,顾亚玲,辛国省.静原鸡AK1基因序列分析及真核表达载体的构建[J].华南农业大学学报,2021,42(2):17-25. |
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| 作者姓名： | 张娟 虎红红 邓占钊 母童 顾亚玲 辛国省 |
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| 作者单位： | 宁夏大学 农学院，宁夏 银川 750021;彭阳县畜牧技术推广服务中心，宁夏 彭阳 756599;宁夏大学 生命科学学院/宁夏饲料工程技术研究中心，宁夏 银川 750021 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31860621) |
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| 摘 要： | 目的 探究宁夏地方品种静原鸡前期转录组测序筛选出的AK1基因编码蛋白的结构与功能，构建其真核表达载体。方法 根据GenBank上已公布的原鸡AK1基因序列，针对其CDS区设计特异性引物，通过克隆测序对AK1基因CDS区SNPs进行快速筛查，构建AK1基因的真核表达载体，并进行编码区生物信息学功能分析。结果 AK1基因编码区全长585 bp，编码194个氨基酸；AK1蛋白无跨膜结构域，存在2个CpG岛，18个磷酸化位点，10个抗原表位，为稳定的水溶性蛋白，空间结构以α–螺旋和无规则卷曲为主。亚细胞定位结果显示，AK1蛋白主要位于细胞质内；GO富集分析发现，AK1基因同样富集在细胞质中，与亚细胞定位结果一致。基因共表达分析发现，在与AK1互作的基因中，AK1与AMPD1、PKM2基因存在共表达，共表达系数分别为0.116和0.063。成功构建出AK1-pEGFP-N1载体。结论 该研究结果为后续AK1蛋白功能以及AK1作为肌苷酸相关基因的深入研究提供了科学依据。
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| 关 键 词： | AK1基因 生物信息学 静原鸡 基因共表达 亚细胞定位 |
| 收稿时间： | 2020/6/18 0:00:00 |
Sequence analysis of AK1 gene from Jingyuan chicken and construction of its eukaryotic expression vector |
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| ZHANG Juan,HU Honghong,DENG Zhanzhao,MU Tong,GU Yaling,XIN Guosheng.Sequence analysis of AK1 gene from Jingyuan chicken and construction of its eukaryotic expression vector[J].Journal of South China Agricultural University,2021,42(2):17-25. |
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| Authors: | ZHANG Juan HU Honghong DENG Zhanzhao MU Tong GU Yaling XIN Guosheng |
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| Institution: | School of Agriculture, Ningxia University, Yinchuan 750021, China;Animal Husbandry and Technology Promotion Service Center of Pengyang County, Pengyang 756599, China; School of Life Science, Ningxia University/ Ningxia Feed Engineering Technology Research Center, Yinchuan 750021, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | AK1 gene bioinformatics Jingyuan chicken gene co-expression subcellular localization |
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