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枸杞Lb_PPR1的克隆及其在不同育性品种中的表达分析
引用本文:管翠萍,杨亚珺,石 晶.枸杞Lb_PPR1的克隆及其在不同育性品种中的表达分析[J].园艺学报,2020,47(8):1521-1529.
作者姓名:管翠萍  杨亚珺  石 晶
作者单位:宁夏大学生命科学学院,西部特色生物资源保护与利用教育部重点实验室,银川 750021
基金项目:宁夏自然科学基金项目(2019AAC03014)
摘    要:三角状五肽重复(Pentatricopeptide repeats,PPR)蛋白定位于多种细胞器中,参与细胞核和细胞器中特异单链RNA的转录后修饰和编辑,在植物生长发育的多个阶段均发挥着重要的作用。分别从枸杞(Lycium barbarum)雄性可育系‘宁杞1号’和不育系‘宁杞5号’中克隆了Lb_PPR1基因,并对其编码蛋白质进行理化性质、亚细胞定位、保守结构域、蛋白结构以及系统进化等方面进行预测分析。结果显示,‘宁杞1号’和‘宁杞5号’中Lb_PPR1基因的开放阅读框均为1 977 bp,编码658个氨基酸,但其中存在20个碱基和14个氨基酸的差异。Lb_PPR1蛋白包含14个串联重复的PPR保守基序,属于PLS家族,该蛋白定位在细胞膜和细胞质。二级、三级结构预测显示该蛋白以α螺旋为主。同源进化分析得出Lb_PPR1蛋白与同属茄科的辣椒和烟草PPR蛋白亲缘关系最近。利用实时荧光定量PCR检测Lb_PPR1在枸杞不同组织器官及不同发育阶段花药中的表达特性。结果显示,Lb_PPR1在枸杞不同组织中均有表达,但在可育系花蕾中表达量最高,不育系‘宁杞5号’各组织中表达量均显著低于可育系‘宁杞1号’。以上结果表明,Lb_PPR1基因可能与枸杞花药发育有关。

关 键 词:枸杞  Lb_PPR1  生物信息  表达模式  

Cloning and Expression Analysis of Lb_PPR1 Gene in Different Lycium barbarum Fertility Varieties
GUAN Cuiping,YANG Yajun,SHI Jing.Cloning and Expression Analysis of Lb_PPR1 Gene in Different Lycium barbarum Fertility Varieties[J].Acta Horticulturae Sinica,2020,47(8):1521-1529.
Authors:GUAN Cuiping  YANG Yajun  SHI Jing
Institution:College of Life Science,Ningxia University;Western Biological Resources Protection and Utilization Lab of National Education Ministry,Yinchuan 750021,China
Abstract:
Keywords:Lycium barbarum  Lb_PPR1  bioinformatics analysis  gene expression pattern  
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