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基于Cytb基因序列研究6种裸胸鳝属鱼类的进化关系
引用本文:杜民,齐兴柱,尹绍武,霍蕊,张本,陈国华.基于Cytb基因序列研究6种裸胸鳝属鱼类的进化关系[J].中国水产科学,2009,16(1).
作者姓名:杜民  齐兴柱  尹绍武  霍蕊  张本  陈国华
作者单位:海南大学,海洋学院,海南大学热带生物资源教育部重点实验室,海南,海口,570228
基金项目:国家科技支撑计划重点项目,国家自然科学基金,海南省自然科学基金,海南大学重点学科建设项目 
摘    要:为探讨中国南海裸胸鳝属(Gymnothorax)鱼类系统发育关系,采用PCR扩增产物克隆到T载体后进行序列测定,获得黄边裸胸鳝(Gymnothorax flavimarginatus)、斑点裸胸鳝(G.meleagris)、波纹裸胸鳝(G.undulatus)、云纹裸胸鳝(G.chilospilus)、匀斑裸胸鳝(G reevesi)5种裸胸鳝的线粒体细胞色素b(cytochrome b,Cyt 6)基因全序列1140 bp.结合GenBank中的蠕纹裸胸鳝(G kidako)Cyt b同源序列进行比较分析.结果表明:(1)1140个位点中共有367个核苷酸位点存在变异(32.2%);(2)序列变异的转换/颠换比值平均为3.223;云纹裸胸鳝和斑点裸胸鳝遗传距离差异最大,为0.226;(3)以花鳗鲡(Anguilla marmortlta)为外群,采用NJ法和MP法构建系统发育树,在所分析的6种裸胸鳝属鱼类中,斑点裸胸鳝和波纹裸胸鳝聚为一支,位于系统树的基部位置,其余4种聚为另外一支.蠕纹裸胸鳝样本来源于日本海,其余5种裸胸鳝来源于中国南海,从系统树上来看,它们之间并没有明显的地域差异.中国水产科学,2009,16(1):23-30]

关 键 词:裸胸鳝属  细胞色素b基因  序列比较  遗传距离

Phylogenetic relationships of 6 species in Gymnothorax based on sequences of cytochrome b gene
DU Min,QI Xing-zhu,YIN Shao-wu,Huo Rui,ZHANG Ben,CHEN Guo-hua.Phylogenetic relationships of 6 species in Gymnothorax based on sequences of cytochrome b gene[J].Journal of Fishery Sciences of China,2009,16(1).
Authors:DU Min  QI Xing-zhu  YIN Shao-wu  Huo Rui  ZHANG Ben  CHEN Guo-hua
Abstract:
Keywords:
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