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不同产地沙棘种子内生菌群落组成与多样性分析
引用本文:李铂,高晓敏,王楠,黄文静,张永生,宋忠兴.不同产地沙棘种子内生菌群落组成与多样性分析[J].北方园艺,2024(8):94-101.
作者姓名:李铂  高晓敏  王楠  黄文静  张永生  宋忠兴
作者单位:1. 陕西中医药大学陕西中药资源产业化省部共建协同创新中心,秦药特色资源研究与开发国家重点实验室(培育);2. 内蒙古海天制药有限公司
基金项目:国家中药材产业技术体系建设专项资助项目(CARS-21);
摘    要:以新疆、内蒙古、山西、陕西、甘肃6个产地的沙棘种子为试材,采用高通量测序及生物信息学分析方法,基于16S rRNA和ITS2序列,研究了沙棘种子内生细菌和真菌的菌群结构与多样性,以期为后续研究沙棘种子内生菌的生物活性,探寻沙棘内生功能菌群提供参考依据。结果表明:沙棘种子内生菌组成较为单一,内生细菌主要为变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)等,内生真菌为子囊菌门(Ascomycota)、被孢霉门(Mortierellomycota)和担子菌门(Basidiomycota);Alpha物种多样性分析结果表明,陕西志丹与新疆阿勒泰样品内生细菌的Shannon指数与Simpson指数存在显著差异;山西吕梁与陕西志丹样品内生真菌的Shannon指数和Chao1指数达到显著差异;NMDS分析显示不同样品的内生菌组成存在一定相似性;KEGG分析内生细菌共获得6个一级代谢系统和26个二级代谢通路。综上,不同产地沙棘种子内生菌多样性与群落组成存在差异性,这可能与其栖息地的环境因子密切相关。

关 键 词:沙棘  种子  内生菌  高通量测序  多样性
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