| 小麦YABBY基因的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 赵伟,宿红艳,王磊. 小麦YABBY基因的生物信息学分析[J]. 现代农业科技, 2009, 0(7) |
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| 作者姓名： | 赵伟 宿红艳 王磊 |
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| 作者单位： | 1. 中国农业科学院农业信息研究所,北京,100081
2. 鲁东大学生命科学学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(30370143;30270651) |
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| 摘 要： | [目的]对小麦YABBY基因家族成员TaYAB1与TaCRC基因进行生物信息学分析。[方法]利用相应的计算机软件及数据库,对这2个基因的理化性质、结构与功能进行分析预测,同时构建其同源基因的系统进化树。[结果]TaYAB1与TaCRC蛋白为不稳定亲水性蛋白,其蛋白结构中无跨膜区,属于非分泌性蛋白。TaYAB1与TaCRC蛋白亚细胞定位于细胞核,有多种二级结构形式。功能分析预测这2个蛋白具有转录与转录调控功能。[结论]在小麦背腹极性建立中,小麦TaYAB1与TaCRC基因可能在转录调控过程中发挥重要作用。
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| 关 键 词： | 小麦 YABBY基因家族 TaYAB1基因 TaCRC基因 生物信息学 |
Bioinformatics Analysis of YABBY genes from wheat |
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| ZHAO Wei,SU Hong-yan,WANG Lei. Bioinformatics Analysis of YABBY genes from wheat[J]. Modern Agricultural Sciences and Technology, 2009, 0(7) |
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| Authors: | ZHAO Wei SU Hong-yan WANG Lei |
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| Affiliation: | 1Institute of Agricultural Information Chinese Academy of Agricultural Sciences;Beijing 100081;2College of Life Sciences Yantai Normal University Yantai Shandong |
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| Abstract: | [Objective] This study aimed to conduct bioinformatics analysis of TaYAB1 and TaCRC in YABBY gene family from wheat.[Method] The physicochemical characteristics,structures and functions of TaYAB1 and TaCRC were predicted and analyzed with software tools and database.Meanwhile,the phylogenetic tree of TaYAB1 and TaCRC and related YABBY proteins was constructed.[Result] TaYAB1 and TaCRC are unstable hydrophilic proteins without transmembrane domains.They are located in nuclear and display several secondary st... |
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| Keywords: | Wheat YABBY gene family TaYAB1 TaCRC Bioinformatics |
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