基于mtDNA-COⅡ基因序列对中国南海裸胸鳝属鱼类分子系统进化关系的研究 |
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引用本文: | 齐兴柱,尹绍武,张本,霍蕊,杜民.基于mtDNA-COⅡ基因序列对中国南海裸胸鳝属鱼类分子系统进化关系的研究[J].水产科学,2010,29(10). |
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作者姓名: | 齐兴柱 尹绍武 张本 霍蕊 杜民 |
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作者单位: | 海南大学,热带生物资源教育部重点实验室,海南,海口,570228 |
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基金项目: | “十一五”国家科技支撑计划重点项目(2007BAD29B03); 国家自然科学基金资助项目(40966003); 海南省教育厅高等学校科研项目(Hjkj2010-13); 海南省自然科学基金资助项目(808122); 海南热带水生生物技术重点实验室开放基金资助项目(shkyjj0801) |
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摘 要: | 采用聚合酶链式反应直接测序法,获得细斑裸胸鳝、黄纹裸胸鳝、云纹裸胸鳝、黑点裸胸鳝、褐裸胸膳5种裸胸鳝属鱼类的细胞色素氧化酶Ⅱ(cytochrome oxidaseⅡ,COⅡ)基因序列(691 bp)。结合GenBank上蠕纹裸胸鳝COⅡ同源序列,采用多个生物软件对6种裸胸鳝属鱼类序列变异和碱基组成进行分析,共发现196个核苷酸位点存在变异(28.36%);计算了它们的相对遗传距离、转换/颠换比等遗传信息指数,6种裸胸鳝属鱼类的序列差异为0.012~0.199,其中云纹裸胸鳝与褐裸胸鳝的序列差异最大,为0.199,细斑裸胸鳝与黄纹裸胸鳝序列的差异最小,为0.012;总体来说,序列中的转换明显多于颠换,转换和颠换的比值(Ts/Tv)为2.7;以长鳝为外群构建NJ、ME、MP系统树,长鳝分为独立的一支,6种裸胸鳝为另外一支,分为3个平行进化的分支。
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关 键 词: | 裸胸鳝属 COⅡ基因 系统进化 |
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