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谷子基因组SSR信息分析和标记开发
引用本文:张晗,王雪梅,王东建,孙加梅,杨延兵,段丽丽,李华,宋国安,王晓宇,李汝玉.谷子基因组SSR信息分析和标记开发[J].分子植物育种,2013(1):30-36.
作者姓名:张晗  王雪梅  王东建  孙加梅  杨延兵  段丽丽  李华  宋国安  王晓宇  李汝玉
作者单位:山东省农业科学院作物研究所;山西省农业科学院谷子研究所
基金项目:山东省自然科学基金(Q2007D05)资助
摘    要:对从Phytozome数据库中获取的谷子基因组序列进行搜索,在21150.78kb序列中发现2872个SSR,平均每7.36kb就有一个SSR;共发现126种重复基元,其中二核苷酸和三核苷酸类型分别占63.41%和31.86%。初步设计了74对SSR引物,其中64对引物可以稳定扩增。利用40对引物对27份谷子品种进行多态性检验,27对引物扩增良好且多态性丰富,共扩增出220个等位变异,平均每个位点8.15个。

关 键 词:谷子  基因组序列  SSR  多态性

Survey of SSRs in Foxtail Millet Genome and Development of SSR Markers
Zhang Han, Wang Xuemei, Wang Dongjian,Sun Jiamei,Yang Yanbing,Duan Lili,Li Hua,Song Guoan,Wang Xiaoyu,Li Ruyu.Survey of SSRs in Foxtail Millet Genome and Development of SSR Markers[J].Molecular Plant Breeding,2013(1):30-36.
Authors:Zhang Han  Wang Xuemei  Wang Dongjian  Sun Jiamei  Yang Yanbing  Duan Lili  Li Hua  Song Guoan  Wang Xiaoyu  Li Ruyu
Institution:1** 1 Crop Research Institute, Shandong Academy of Agricultural Sciences, Ji’nan, 250100; 2 Millet Research Institute, Shanxi Academy of Agricultural Sciences, Changzhi, 046011
Abstract:
Keywords:
本文献已被 CNKI 等数据库收录!
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