| 小麦RPD3/HDA1基因家族的全基因组鉴定及其对热胁迫的响应 |
| |
| 引用本文： | 郑文杰,党仁美,丁 宁,刘媛媛,闻珊珊.小麦RPD3/HDA1基因家族的全基因组鉴定及其对热胁迫的响应[J].西北农业学报,2019,28(3):362-370. |
| |
| 作者姓名： | 郑文杰 党仁美 丁 宁 刘媛媛 闻珊珊 |
| |
| 作者单位： | (西北农林科技大学 农学院，陕西杨凌 712100 |
| |
| 基金项目： | 引进人才科研启动费（Z111021401）。 |
| |
| 摘 要： | RPD3/HDA1是组蛋白去乙酰化酶(histone deacetylase,HDACs)家族中最大的亚族,已知的HDAC家族基因在拟南芥、水稻等植物的生长发育和非生物胁迫方面都发挥着重要作用,但小麦中对HDACs的研究却较少。为探究小麦中 RPD3/HDA1家族基因对热胁迫的响应,本试验利用生物信息学方法,从小麦全基因组中鉴定出36个小麦 RPD3/HDA1基因,并对其基因结构、进化关系、顺式作用元件和热胁迫下的表达模式进行分析。结果表明:除3A和4A外,其余小麦染色体均含有该家族基因,其基因结构中外显子和内含子的数目差异明显。该小麦家族基因在不同组织和不同逆境胁迫中存在差异表达, TaHDAC-Ⅱ-3a、 TaHDAC-Ⅱ-3b和 TaHDAC-Ⅱ-3d在叶片中的表达量明显高于其他组织, TaHDAC-Ⅰ-2d、 TaHDAC-Ⅰ-2a和 TaHDAC-Ⅰ-2b在热胁迫后表达量有明显上调。进一步研究发现,不同基因在同一生育时期的热胁迫下响应不同,同一基因在不同生育时期对热胁迫的响应也不同,并且相对于35℃而言,多数基因对42℃胁迫响应更显著。这些结果对寻找小麦 RPD3/HDA1家族候选耐热基因具有重要的参考价值。
|
| 关 键 词： | 小麦 RPD3/HDA1家族 全基因组鉴定 热胁迫 实时荧光定量PCR |
Genome-wide Identification of Wheat RPD3/HDA1 Genes Family and Its Response to Heat Stress |
| |
| ZHENG Wenjie,DANG Renmei,DING Ning,LIU Yuanyuan and WEN Shanshan.Genome-wide Identification of Wheat RPD3/HDA1 Genes Family and Its Response to Heat Stress[J].Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica,2019,28(3):362-370. |
| |
| Authors: | ZHENG Wenjie DANG Renmei DING Ning LIU Yuanyuan and WEN Shanshan |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | Triticum aestivum L RPD3/HDA1 family Genome-wide identification Heat stress Real-time PCR |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《西北农业学报》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《西北农业学报》下载免费的PDF全文 |
|
