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洋葱AcLOX1基因的克隆及其表达分析
引用本文:李倩,赵泓,刘倩纯,温常龙,黄科,王永勤. 洋葱AcLOX1基因的克隆及其表达分析[J]. 农业生物技术学报, 2016, 0(4): 548-556. DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2016.04.009
作者姓名:李倩  赵泓  刘倩纯  温常龙  黄科  王永勤
作者单位:1. 湖南农业大学园艺园林学院,长沙410128;北京农林科学院蔬菜研究中心/农业部华北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室,北京100097;2. 北京农林科学院蔬菜研究中心/农业部华北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室,北京,100097;3. 湖南农业大学园艺园林学院,长沙,410128
基金项目:国家自然科学基金(No.31372066)、北京市自然科学基金(No.6132016)和北京市农林科学院科技创新能力建设专项(No.KJCX2014011)
摘    要:脂氧合酶(lipoxygenase,LOX)是植物十八碳酸代谢途径的关键酶,与种子老化密切相关.洋葱(Allium cepa)种子为短寿命种子.研究LOX基因与洋葱种子发育及老化的关系具有重要的意义.本研究以洋葱授粉后的子房和种子为材料,利用RT-PCR结合快速克隆cDNA末端(rapid-amplification of cDNA ends,RACE)技术,获得AcLOX1 (GenBank登录号:KU363822)基因全长.用生物信息学方法对其基因序列特征进行分析;利用RT-PCR和qRT-PCR分析AcLOX1在洋葱不同部位、种子发育过程以及种子储存过程中的表达模式.结果表明,该基因全长为2 847 bp,包含一个2 619 bp的开放阅读框,编码873个氨基酸.氨基酸序列分析表明,AcLOX1具有PLAT_LH2 (polycystin-1,lipoxygenase,alpha-toxin_lipoxygenase homology)和LOX两种结构域;与桉树(Eucalyptus grandis)、杏(Prunus dulcis)、葡萄(Vitis vinifera)等物种的LOX基因氨基酸序列同源性高达66%~73%.系统进化树分析表明,AcLOX1与其他物种的9-LOX聚在一起.时空表达模式表明,AcLOX1基因在洋葱各组织中均有表达,在授粉后5~25 d随着时间增长其表达量增加,但在授粉后25 d到成熟及储存一年的种子中少量持续表达.本实验初步证实了AcLOX1对洋葱种子发育具有促进作用且与种子老化相关联,为阐明洋葱种子短寿命的作用机制提供了理论依据.

关 键 词:洋葱  种子老化  洋葱脂氧合酶基因(AcLOX1)  克隆  功能分析

Cloning and Expression Analysis of AcLOX1 Gene in Onion (Allium cepa)
Abstract:
Keywords:Onion  Seed aging  Onion lipoxygenase gene (AcLOX1)  Cloning  Functional analysis
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