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绵羊LDHAL6A基因的电子克隆与生物信息学预测
引用本文:
闫秋良,翟洪军,马惠海,金海国,李双双,曹阳,武斌,赵玉民. 绵羊LDHAL6A基因的电子克隆与生物信息学预测[J]. 广东农业科学, 2013, 40(10): 155-158
作者姓名:
闫秋良
翟洪军
马惠海
金海国
李双双
曹阳
武斌
赵玉民
作者单位:
中国农业科技东北创新中心;吉林省农业科学院畜牧科学分院;长岭县动物疫病控制中心
基金项目:
吉林省人力资源和社会保障厅项目
摘 要:
以人LDHAL6A基因的cDNA序列为探针,利用生物信息学方法,对绵羊LDHAL6A基因进行了电子克隆,并对推导出LDHAL6A基因编码的蛋白结构与性质进行了预测。结果表明:绵羊LDHAL6A基因的cDNA序列全长为1798bp,包括999 bp的编码区和149bp的5ˊ非翻译区(5ˊUTR)、650 bp的3ˊ非翻译区序列(3ˊUTR),编码合成332个氨基酸的多肽;其编码蛋白属疏水性蛋白,不存在信号肽及跨膜结构,定位于内质网上;无规则卷曲、琢-螺旋是绵羊LDHAL6A蛋白主要的二级结构元件。绵羊LDHAL6A基因编码蛋白可能在精子生成过程中起重要作用。
关 键 词:
绵羊;LDHAL6A基因;电子克隆;生物信息学
In silico cloning and bioinformatic prediction of sheep LDHAL6A gene
Abstract:
Keywords:
sheep
LDHAL6A gene
in silico cloning
bioinformatics
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