不同农田生境对通俗腔蚓肠道菌群结构的影响

【目的】蚯蚓肠道微生物种类繁多，其中细菌群落对蚯蚓适应不同的生境具有重要作用，而关于蚯蚓肠道菌群的研究多集中于养殖型蚯蚓，野生蚯蚓的研究相对缺乏。【方法】为解析不同生境野生蚯蚓肠道的菌群差异，本研究采集河北省沧州市农林科学院试验田中的黄瓜地和辣椒地的通俗腔蚓（Metaphire vulgaris），并通过高通量测序对其肠道细菌群落进行了分析。提取蚯蚓肠道微生物总DNA，特异性扩增16S rRNA基因的V3-V4区，利用Illumina Hiseq 2500测序平台进行双端测序，然后对OTU(operational taxonomic unit)归类，并进行物种组成分析、Alpha和Beta多样性分析、样品组间统计分析。【结果】蚯蚓肠道分离土样中CZM（采自辣椒地的蚯蚓）和CZH（采自黄瓜地的蚯蚓）相对丰度大于1%的优势菌属分别为12和13个，肠道细菌中门水平相对丰度最高的是变形菌（Proteobacteria）。同时，还发现一些未分类的细菌，CZH肠道菌群中未分类的细菌较多，且CZH肠道细菌多样性指数也高于CZM。此外，CZH和CZM肠道细菌中丰富度位于前30且有属类分析的OTU代表性...