1株基因Ⅶ型新城疫病毒的生物学特性研究及全基因组序列分析

为研究当前流行的新城疫病毒（Newcastle disease virus，NDV）基因型、致病性及其与传统新城疫病毒疫苗株（La Sota等）的核苷酸差异，试验从某发病鸡场病死鸡体内分离到1株疑似NDV毒株，经红细胞凝集试验（HA）和红细胞凝集抑制试验（HI）初步确定为鸡源NDV。参照GenBank公布的NDV F基因部分片段（登录号：JF950510.1）设计1对引物，通过RT-PCR技术扩增分离株的F基因并克隆、测序，测序结果与NCBI中NDV F基因序列进行比对，构建系统进化树并分析其基因型；通过测定鸡胚平均致死时间（MDT）、1日龄鸡脑内致病指数（ICPI）和6周龄鸡静脉致病指数（IVPI）判断病毒致病性；参照GenBank公布的NDV全基因组序列（登录号：JF950510.1）设计9对引物对分离株进行全基因组序列测定，并分析其基因组结构。结果表明，RT-PCR扩增得到F基因长约500 bp，基于F基因构建的系统进化树显示分离株为基因Ⅶ型NDV；MDT、ICPI和IVPI分别为52.8 h、1.675和2.46，表明分离株属于强毒株。全基因组序列分析显示，分离株全基因组全长15 192 bp，与传统La Sota株基因组相比，序列多出6个碱基，核苷酸序列同源性82.8%。本研究成功分离到1株基因Ⅶ型NDV强毒株，且与传统疫苗毒株La Sota的核苷酸序列同源性差异较大。