Cdc42基因对不同发育阶段无尾鸡骨骼的共表达调控

为阐明细胞分裂周期42（cell division cycle 42，Cdc42）基因在无尾鸡骨骼发育过程的潜在调控机制，本试验通过混池重测序与转录组测序方法，综合运用基因组学和骨骼转录组学来揭示Cdc42基因对无尾鸡尾部发育的遗传影响。结果显示，在无尾品种的强正向选择下，无尾鸡与有尾鸡之间高度分化的基因显著富集到神经发育、基础代谢与细胞骨架重排等生物类别；骨骼发育过程的差异表达基因数从胚胎第8、11和14天逐渐升高后下降，到第16天到达最低后又升高，到第21天达到最高；在基因组与转录组层面识别的公共候选基因为Cdc42；公共生物学过程富集到GTPases活性与细胞生长程度的调节，公共信号通路富集到紧密连接与黏着连接；差异表达基因构建的权重基因共表达网络发现，无尾鸡比有尾鸡的基因网络密度高6倍以上，平均连接度高8倍以上。无尾鸡共表达网络中，Cdc42基因与其他基因的相关性较弱。相比而言，在有尾鸡组，Cdc42基因处于网络的核心连接节点处，对于多基因的共同调节起到桥梁作用；此外，证明了Cdc42基因在多物种间具有保守性。本研究最终确定瓢鸡无尾性状的形成可能通过Cdc42及其共表达的基因共同调控紧密连接信号通路，联动影响Wnt信号通路，进而干扰生长板和尾骨的发育，是尾骨提前终止的重要影响环节，将为瓢鸡无尾表型的早期启动和遗传基础认识提供理论指导。

Co-expression Regulation of Cdc42 Gene in the Bone of Rumpless Chickens at Different Developmental Stages