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江豚线粒体Cyt b和D-loop片段序列分析及其分子系统学研究
引用本文:孙希福,高天翔,窦存银,汤哲斌,刘军.江豚线粒体Cyt b和D-loop片段序列分析及其分子系统学研究[J].南方水产,2009,5(5):24-31.
作者姓名:孙希福  高天翔  窦存银  汤哲斌  刘军
作者单位:1. 中国海洋大学教育部海水养殖重点实验室,山东,青岛,266003
2. 南京市渔政渔港监督管理处,江苏,南京,210003
基金项目:国家重点基础研究发展计划(973计划)项目 
摘    要:对江豚(Neophocaena phocaenoides)mtDNA的Cyt b(377bp)和D—loop(343bp)片段进行了测序和分析,并与GenBank中鼠豚类及一角鲸类同源序列进行了比较。研究结果表明,Cytb基因片段的碱基组成平均为T:29.0%,C:28.8%,A:27.2%,G:15.0%;D—loop片段的碱基组成平均为T:35.9%,C:21.8%,A:32.4%,G:9.9%。Cytb基因片段共出现109个变异位点,简约信息位点107个,序列变异度为28.9%,碱基替代主要发生在密码子第3位点上,转换/颠换为13.3;D—loop片段共有109个变异位点,简约信息位点100个,序列变异度为31.8%,转换/颠换为2.4。构建的系统发育树显示,江豚是鼠豚科中较早分化出来的一个类群,与一角鲸科的亲缘关系最近。2个片段序列的分析结果一致,棘鳍鼠海豚Phocoena spinipinnis、太平洋鼠海豚P.sinus和黑眶鼠海豚Australophocaena dioptria聚为一支。

关 键 词:江豚  Cyt  b  D-loop  系统发育

Sequence analysis of mitochondral Cyt b gene, D-loop and molecular phylogeny of Neophocaena phocaenoides
SUN Xifu,GAO Tianxiang,DOU Cunyin,TANG Zhebin,LIU Jun.Sequence analysis of mitochondral Cyt b gene, D-loop and molecular phylogeny of Neophocaena phocaenoides[J].South China Fisheries Science,2009,5(5):24-31.
Authors:SUN Xifu  GAO Tianxiang  DOU Cunyin  TANG Zhebin  LIU Jun
Abstract:
Keywords:Cyt b  D-loop
本文献已被 维普 万方数据 等数据库收录!
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