| 榅桲4CL基因的克隆与生物信息学分析 |
| |
| 引用本文： | 杨波,车玉红,郭春苗,木巴热克·阿尤普,吴津蓉,杜鹃.榅桲4CL基因的克隆与生物信息学分析[J].新疆农业科学,2021,58(6):1055-1063. |
| |
| 作者姓名： | 杨波 车玉红 郭春苗 木巴热克·阿尤普 吴津蓉 杜鹃 |
| |
| 作者单位： | 1.新疆农业科学院园艺作物研究所,乌鲁木齐 830091; 2.新疆农业职业技术学院,新疆昌吉 831100 |
| |
| 基金项目： | 新疆维吾尔自治区自然科学基金(2018D01A45) |
| |
| 摘 要： | 【目的】克隆榅桲果肉(Cydonia oblonga Mill)中4-香豆酸辅酶A连接酶(4-coumarate CoA ligase,4CL)基因,研究其序列特征,为该基因在榅桲果实发育过程中的作用和功能奠定基础。【方法】以榅桲果肉为试材,基于GenBank报道的近缘物种4CL基因cDNA序列,应用Primer Premier 5.0软件设计PCR扩增引物。提取榅桲总RNA,经反转录后合成cDNA,应用RT-PCR方法成功扩增出4CL基因片段并克隆到pMD18-T载体。通过DNAstar软件进行同源序列比对,ClustalX结合MEGA4.1软件构建系统进化树,采用Protparam在线程序分析蛋白质的理化性质,用DNAstar的Protean程序预测二级结构。【结果】榅桲4CL基因其开放阅读框(ORF)序列为1 710 bp,编码570个氨基酸,蛋白分子质量为68.4 kD,与其他物种序列同源性最高达91.99%,进化关系上与水密桃较近;榅桲4CL蛋白为亲水性蛋白,二级结构中以无规卷曲(Random coil)为主,占比达到44.27%。【结论】获得了榅桲4CL基因全长编码区序列,探明了该序列的结构特征。
|
| 关 键 词： | 榅桲 4CL 克隆 序列分析 |
| 收稿时间： | 2020-09-03 |
Cloning and bioinformation analysis of 4CL gene in Cydonia oblonga Mill |
| |
| YANG Bo,CHE Yuhong,GUO Chunmiao,Mubareke·Ayoupu,WU Jingrong,DU Juan.Cloning and bioinformation analysis of 4CL gene in Cydonia oblonga Mill[J].Xinjiang Agricultural Sciences,2021,58(6):1055-1063. |
| |
| Authors: | YANG Bo CHE Yuhong GUO Chunmiao Mubareke·Ayoupu WU Jingrong DU Juan |
| |
| Institution: | 1. Institute of Horticulture,Xinjiang Academy of Agricultural Sciences; Urumqi 830091, China; 2. Xinjiang Agricultural Professional Technology College; Changji Xinjiang 831100,China |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | Cydonia oblonga Mill 4CL clone sequence analysis |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《新疆农业科学》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《新疆农业科学》下载免费的PDF全文 |
|
