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犬瘟热病毒分离株N、H、F蛋白基因的变异分析
引用本文:王旭荣,王小辉,张世栋,李世宏,潘虎,严作廷.犬瘟热病毒分离株N、H、F蛋白基因的变异分析[J].中国畜牧兽医,2011,38(8):71-77.
作者姓名:王旭荣  王小辉  张世栋  李世宏  潘虎  严作廷
作者单位:中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所 中国农业科学院临床兽医学研究中心,甘肃兰州 730050
摘    要:通过RT-PCR方法扩增到犬瘟热病毒(canine distemper virus,CDV)分离株GS0812-4的N、H、F蛋白基因,然后克隆入pGEM-T Easy载体并进行序列分析和抗原表位预测分析。结果表明,GS0812-4分离株的N、H、F蛋白基因与其他分离株相应序列的核苷酸同源性分别为93.2%~97.8%、90.3%~97.3%、93.2%~97.8%,其推定的氨基酸同源性分别为96.6%~98.7%、91.3%~97.9%和96.6%~98.7%;GS0812-4分离株N、H、F蛋白基因与疫苗株相应序列的核苷酸同源性分别为93.1%~93.8%、89.4%~90.5%、93.1%~93.8%,其推定的氨基酸同源性分别为96.4%~97.3%、89.3%~91.3%、96.4%~97.3%。由基因系统发育树可知,GS0812-4与疫苗株处于不同的分支,其中与MKY-KM08的亲缘关系最近,但GS0812-4在N、H、F 3个基因系统发育树上与其他同一毒株的亲缘关系远近不同。H、F蛋白的抗原表位预测结果表明,GS0812-4与MKY-KM08和疫苗株的抗原表位均有差异。说明GS0812-4是野毒株,与MKY-KM08属于同一基因型,来源于同一毒株,但两毒株间的H蛋白和F蛋白的抗原表位仍有差异。

关 键 词:犬瘟热病毒  H蛋白  H蛋白  F蛋白  变异分析  
收稿时间:2010-12-21

Genetic Diversity Analysis of the N, H, F Protein Genes of Canine Distemper Virus Isolate
WANG Xu-rong,WANG Xiao-hui,ZHANG Shi-dong,LI Shi-hong,PAN Hu,YAN Zuo-ting.Genetic Diversity Analysis of the N, H, F Protein Genes of Canine Distemper Virus Isolate[J].China Animal Husbandry & Veterinary Medicine,2011,38(8):71-77.
Authors:WANG Xu-rong  WANG Xiao-hui  ZHANG Shi-dong  LI Shi-hong  PAN Hu  YAN Zuo-ting
Institution:Research Center of Clinical Veterinary Medicine,Chinese Academy of Agricultural Sciences, Lanzhou Institute of Animal Science and Veterinary Pharmaceutics, Chinese Academy of Agricultural Sciences,Lanzhou 730050,China
Abstract:
Keywords:CDV  nucleoprotein(N)  fusion protein(F)  haemgagglutinin protein(H)  genetic diversity
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