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大白菜自交系背景选择InDel标记与重要农艺性状的关联分析
作者姓名:赵玉靖  卢银  冯大领  罗蕾  吴芳  杨锐  陈悦琦  孙晓雪  王彦华  陈雪平  申书兴  罗双霞  赵建军
作者单位:河北农业大学园艺学院/华北作物改良与调控国家重点实验室/河北省蔬菜种质创新与利用重点实验室/河北省蔬菜产业协同创新中心,河北保定 071001河北省农林科学院经济作物研究所,石家庄 050051
基金项目:国家重点研发计划项目(2017YFD0101802,2016YFD0100204-17);;河北省自然科学基金创新群体研究项目(C2020204111);;河北省自然科学基金面上项目(C2020204122);;河北省高等学校科学技术研究项目(BJ2019020);
摘    要:InDel背景选择标记有利于大白菜育种亲本的高效选配。以31份不同类型大白菜自交系为材料进行农艺性状变异分析、InDel标记遗传背景和群体结构分析,并将多态性标记与农艺性状相关联。结果显示,31个农艺性状的变异系数变幅为15.97% ~ 47.63%,平均为32.58%,表明供试群体表型变异丰富;从177对InDel引物中筛选出158对多态性引物,在31份材料中共检测出701个多态性等位变异位点,平均每对引物检测到等位变异位点4.418个,变幅为1 ~ 11个;标记位点的多态性信息含量(PIC)变幅为0.612 ~ 0.963,平均为0.843;有效等位基因变异数(Ne)变幅为1.656 ~ 3.985,平均为2.640;供试材料遗传相似系数(GS)在0.575 ~ 0.910之间,变化幅度较大,说明群体的遗传背景具有较大差异。群体结构分析将供试材料划分为3个亚群;关联分析发现分布于9个连锁群的22个InDel标记与供试材料的12个农艺性状(开展度、全株质量、球叶数、外叶数、叶片宽、叶片长、叶球高、叶球宽、叶球质量、中肋长、中心柱长和株高)相关。

关 键 词:大白菜  遗传多样性  InDel  关联分析  背景选择  
收稿时间:2021-04-27
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