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梨Trihelix转录因子家族成员鉴定及表达分析
引用本文:韩文龙,朱振,李君茹,陈天哲,李国辉,苏雪强,金青,程曦,蔡永萍. 梨Trihelix转录因子家族成员鉴定及表达分析[J]. 园艺学报, 2021, 0(3): 439-455
作者姓名:韩文龙  朱振  李君茹  陈天哲  李国辉  苏雪强  金青  程曦  蔡永萍
作者单位:安徽农业大学生命科学学院;地方特色植物资源开发与利用安徽省工程技术中心
基金项目:安徽省自然科学基金项目(2008085QC100);安徽农业大学青年基金项目(2019zd01);安徽农业大学稳定和引进人才项目(yj2019-17);安徽省级大学生创新基金项目(201910364156)。
摘    要:Trihelix转录因子可以和光应答相关的GT元件结合,因此又称GT转录因子。本研究从梨基因组中鉴定出16个Trihelix家族基因,依次命名为PbGT1~PbGT16,从同属于蔷薇科的草莓和桃基因组中分别鉴定出11和16个Trihelix家族基因。染色体定位与基因复制事件分析表明,梨、草莓和桃Trihelix家族成员分别分布在12、6和8条染色体上,且梨Trihelix家族存在片段复制事件。种间系统进化树分析表明,梨、草莓和桃Trihelix家族成员分为6个亚族,梨家族成员(PbGT)属于GT-2、Subfamily O和SIP1亚族。结合进化关系及qRT-PCR验证,筛选出PbGT15可能参与调控梨果实石细胞团木质化。

关 键 词:  Trihelix转录因子  比较基因组学  表达分析  木质化

Indentification and Expression Analysis of Trihelix Transcription Factor Family in Pear
HAN Wenlong,ZHU Zhen,LI Junru,CHEN Tianzhe,LI Guohui,SU Xueqiang,JIN Qin,CHENG Xi,and CAI Yongping. Indentification and Expression Analysis of Trihelix Transcription Factor Family in Pear[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2021, 0(3): 439-455
Authors:HAN Wenlong  ZHU Zhen  LI Junru  CHEN Tianzhe  LI Guohui  SU Xueqiang  JIN Qin  CHENG Xi  and CAI Yongping
Affiliation:(School of Life Science,Anhui Agricultural University,Hefei 230036,China;Anhui Provincial Engineering Technology Center for Development&Utilization of Regional Characteristic Plants,Hefei 230036,China)
Abstract:
Keywords:
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