低温对罗非鱼基因组DNA甲基化的影响 |
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作者姓名: | 朱华平 卢迈新 黄樟翰 高风英 可小丽 刘志刚 李庆勇 刘玉姣 |
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作者单位: | 中国水产科学研究院珠江水产研究所,农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室;中国水产科学研究院珠江水产研究所,农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室;中国水产科学研究院珠江水产研究所,农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室;中国水产科学研究院珠江水产研究所,农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室;中国水产科学研究院珠江水产研究所,农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室;中国水产科学研究院珠江水产研究所,农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室;中国水产科学研究院珠江水产研究所,农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室;中国水产科学研究院珠江水产研究所,农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31001108);中国水产科学研究院基本科研业务费(2012A0404);现代农业产业技术体系建设专项(CARS-49);广东省自然科学基金项目(9451038001003595) |
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摘 要: | 以经过连续多代抗寒选育获得的尼罗罗非鱼耐寒品系为实验材料,采用DNA甲基化敏感扩增多态性(methylation sensitive amplified polymorphism,MSAP)分析方法从全基因组水平上探讨了低温适应对罗非鱼DNA序列中CCGG位点的甲基化水平的影响。结果显示,选用的18对选择性扩增引物共检测到849个位点。耐寒品系检测到的位点数为411个,对照组为438个,其中发生甲基化的位点数分别为72和104个,总甲基化率分别为17.52%和23.74%;全甲基化位点分别为37个和65个,全甲基化率分别为9.00%和14.84%;半甲基化位点分别为35个和39个,半甲基化率分别为8.52%和8.90%。结果分析表明,尼罗罗非鱼耐寒品系的总甲基化水平、全甲基化水平和半甲基化水平较对照组均有一定程度的下降。与对照组相比,尼罗罗非鱼耐寒品系基因组DNA甲基化总体水平下降了6.22%,其中以全甲基化位点变异为主,其下降幅度比例明显,为5.84%。由此可见,经过连续多代的低温胁迫可导致尼罗罗非鱼DNA甲基化水平发生改变,发生了去甲基化反应,表现为基因组甲基化程度降低的特征,说明了DNA甲基化与罗非鱼抗寒性反应密切相关。
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关 键 词: | 尼罗罗非鱼 低温 DNA甲基化 甲基化敏感扩增多态性 |
收稿时间: | 2013-03-11 |
修稿时间: | 2013-05-24 |
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