河北苹果坏死花叶病毒的发生及近全基因组序列的测定与分析 |
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引用本文: | 董震杨,李紫腾,胡同乐,王树桐,王亚南,曹克强.河北苹果坏死花叶病毒的发生及近全基因组序列的测定与分析[J].河北农业大学学报,2023(1):72-79. |
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作者姓名: | 董震杨 李紫腾 胡同乐 王树桐 王亚南 曹克强 |
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作者单位: | 河北农业大学植物保护学院 |
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基金项目: | 河北省自然科学基金(C2022204196);;国家现代农业(苹果)产业技术体系(CARS-27); |
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摘 要: | 为明确苹果坏死花叶病毒(Apple necrotic mosaic virus, ApNMV)在河北的发生及其基因组特性,本试验利用RT-PCR技术对河北保定两地ApNMV发病情况进行检测,然后通过高通量测序技术对带毒样本进行序列测定和分析。结果表明,河北农大果园‘红珍珠’‘锦锈红’‘信侬红’3个品种及保定唐县苹果实验基地富士品种ApNMV检出率分别为9.09%、18.18%、100%和65%。ApNMV阳性果树高通量测序结果显示,果树为ApNMV、苹果褪绿叶斑病毒(Apple chlorotic leaf spot virus, ACLSV)、苹果茎沟病毒(Apple stem grooving virus, ASGV)和苹果茎痘病毒(Apple stem pitting virus, ASPV)复合侵染,ApNMV河北分离物(ApNMV-HB)的近全基因组序列包含RNA1~RNA3序列,GenBank登录号分别为OP019626、OP019627和OP019628。RNA1编码120 kD的甲基转移酶/NTP-binding解旋酶(MET/HEL),RNA2编码97 kD的RNA聚...
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关 键 词: | 苹果坏死花叶病毒 高通量测序 基因组特性 系统进化 |
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