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家兔肌肉组织中保守miRNA的鉴定及进化分析
引用本文:
张翔宇,张翠霞,张凯,袁定胜,李钰莹,邝良德,李丛艳,郑洁,任永军,郭志强,唐丽,季杨,杨锐,雷岷,黄邓萍,谢晓红,杨超.家兔肌肉组织中保守miRNA的鉴定及进化分析[J].四川农业大学学报,2023(4):713-718.
作者姓名:
张翔宇
张翠霞
张凯
袁定胜
李钰莹
邝良德
李丛艳
郑洁
任永军
郭志强
唐丽
季杨
杨锐
雷岷
黄邓萍
谢晓红
杨超
作者单位:
1. 四川省畜牧科学研究院/动物遗传育种四川省重点实验室;2. 四川省草原科学研究院
摘 要:
【目的】旨在鉴定家兔肌肉组织中的保守miRNA,获取其表达谱并分析其进化特征,进而为研究保守性miRNA在家兔生长发育过程中的生物学功能提供理论依据。【方法】采用Solexa技术对家兔背最长肌组织中miRNA进行了测序和分析。【结果】通过序列比对鉴定出521个保守的miRNA序列,分属于238个不同的家族。其中miR-1、miR-133、miR-206和miR-499等肌肉特异性表达的miRNA在肌肉中均有表达,且除miR-499外的其它3个miRNA在所测定样本中均高表达。10个动物保守性miRNA家族在S86专门化父系肌肉基因组中出现了丢失。靶基因显著富集于13条信号通路,其中Focal adhesion和PI3K-Akt信号通路与肌肉发育密切相关。【结论】研究鉴定的影响肌肉发育的miRNA及其靶基因富集通路,将有助于家兔生长调控机制的研究,加快可用于标记辅助选择的分子标记的开发。
关 键 词:
家兔
Solexa测序
微小RNA
生物信息学方法
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