猪脑心肌炎病毒GXLC株的分离及其3D基因分子特征的分析

采集临床疑似脑心肌炎死亡仔猪的组织作为接种材料，接种于BHK-21细胞系，观察细胞病变（CPE），并用RT-PCR和间接荧光抗体试验（IFA）进行鉴定，证实分离到1株脑心肌炎病毒（encephalomyocarditis virus，EMCV），命名为GXLC株。应用RT-PCR方法扩增GXLC株的3D基因，扩增产物克隆入pMD18-T载体后进行测序，对获得的3D基因序列进行分析。序列分析结果表明，GXLC株3D基因全长1380 nt，编码460个氨基酸，含有7个抗原表位。同源性分析结果表明，GXLC株与国内外其它EMCV分离株3D基因核苷酸序列的同源性在84.7%～99.7%之间，氨基酸序列的同源性在96.1%～99.6%之间。遗传进化分析结果表明，基于3D基因核苷酸序列绘制的系统进化树可将所有EMCV分离株分成2个群：Ⅰ群和Ⅱ群，Ⅰ群可再细分为Ⅰa亚群和Ⅰb亚群，其中猪源EMCV在Ⅰ群和Ⅱ群中均有分布，而鼠源EMCV分布在Ⅰ群，人源EMCV分布在Ⅱ群；GXLC株与其它中国分离株均属于Ⅰa亚群。