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小麦OSCA基因家族全基因组鉴定及表达分析
引用本文:张红娟,朱德鹤,杜琳颖,等.小麦OSCA基因家族全基因组鉴定及表达分析[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2022,50(12):25-33.
作者姓名:张红娟  朱德鹤  杜琳颖  
作者单位:杨凌职业技术学院 生物工程分院;西北农林科技大学 植物保护学院;西北农林科技大学 生命科学学院
基金项目:国家自然科学基金面上项目(32072002)
摘    要:【目的】在全基因组水平对小麦(Triticum aestivum L.)OSCA家族成员(TaOSCAs)进行鉴定,以明确TaOSCA在小麦中的潜在生物学功能。【方法】利用BLASTP结合保守结构域筛选的方法鉴定小麦TaOSCA蛋白。用生物信息学方法分析TaOSCA基因家族成员系统发育关系,基因结构及跨膜结构域;利用公开的转录组数据分析TaOSCA在小麦不同发育阶段不同器官/组织的表达谱;以小麦品种中国春为材料,进行PEG-6000模拟的渗透胁迫处理,用实时荧光定量PCR检测叶片TaOSCAs在渗透胁迫下表达模式。【结果】从小麦中鉴定到35个TaOSCA蛋白;TaOSCAs分为TaOSCAⅠ、TaOSCAⅡ、TaOSCAⅢ和TaOSCAⅣ 4个亚家族,分别有15,16,3和1个成员。基因结构分析结果表明,除TaOSCA4.1-4B外,其余TaOSCA均包含多个外显子。跨膜结构域分析结果表明,除TaOSCA2.3-4B有5个跨膜结构域(TMs)外,其余TaOSCA成员均包含8~11个TMs。TaOSCAs在小麦不同发育时期各器官中的表达结果表明,TaOSCA1.1-3B/3D、TaOSCA1.2-1A/1B/1D、TaOSCA1.3-1A、TaOSCA1.6-1A/1D和TaOSCA3.1-2B/2D在全生育期高水平表达,TaOSCA1.4-2A/2B/2D在不同发育阶段的根组织中均高表达,TaOSCA1.5-1B/1D在生殖生长期穗中高表达,TaOSCA1.6-1B、TaOSCA2.6-3B/3D在生殖生长期籽粒中高表达,表明这些基因可能在根、穗及籽粒发育过程中发挥重要功能。渗透胁迫处理下,TaOSCA2.4TaOSCA4.1表达下调,TaOSCA2.5的表达无显著变化,TaOSCA1.1、TaOSCA1.2等11个TaOSCA基因表达上调,说明这11个基因可能在小麦苗期响应渗透胁迫中发挥作用。【结论】TaOSCA基因可能在小麦响应渗透胁迫的过程中发挥重要作用。

关 键 词:小麦  干旱胁迫  TaOSCA  系统发育  特异性表达
收稿时间:2022/2/22 0:00:00

Genome-wide identification and expression analysis of the OSCA gene family in wheat
ZHANG Hongjuan,ZHU Dehe,DU Linying,et al.Genome-wide identification and expression analysis of the OSCA gene family in wheat[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2022,50(12):25-33.
Authors:ZHANG Hongjuan  ZHU Dehe  DU Linying  
Abstract:
Keywords:wheat  drought stress  TaOSCA  phylogenetic analysis  specific expression
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