| 弧菌基因组中整合性接合元件（ICEs）的预测分析 |
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| 引用本文： | 龚 丽,陈兰明. 弧菌基因组中整合性接合元件（ICEs）的预测分析[J]. 广东农业科学, 2015, 42(16): 96-95 |
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| 作者姓名： | 龚 丽 陈兰明 |
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| 作者单位： | 上海海洋大学食品科学与技术学院，上海 201306 |
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| 基金项目： | 上海市教育委员会项目（B-9500-10-0004）作者简介：龚丽（1989-），女，在读硕士生，E-mail：emo_jun@163.com |
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| 摘 要： | 整合性接合元件(ICEs)是一种广泛存在于细菌中可以自主移动的遗传元件。ICEs通过水平移动整合到弧菌的染色体上,所携带的新基因有助于宿主在特定生存环境下获得生长优势。为考察ICEs在弧菌生长中发挥的作用,采用Prf C位点与核心基因相关的特征蛋白,进行了26株弧菌SXT/R391ICEs的预测。结果表明,在全测序的26株弧菌中,只有3株霍乱弧菌的较大染色体上存在SXT/R391ICEs,对这3株霍乱弧菌上SXT/R391ICEs的抗性基因和热点区域进行比较分析,结果表明,3株霍乱弧菌的SXT/R391ICE的抗性基因和热点区域虽然都拥有类似的骨架结构,但从获取基因的得失情况可以判断,这3株菌SXT/R391ICE的进化优先关系。
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| 关 键 词： | 弧菌；整合性接合元件；全基因组 |
Predictive analysis of integrative and conjugative elements (ICEs) in completely sequenced Vibrio genomes |
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