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花生干旱胁迫响应基因的数字表达谱分析
引用本文:孙爱清,张杰道,万勇善,刘风珍,张昆,孙利.花生干旱胁迫响应基因的数字表达谱分析[J].作物学报,2013,39(6):1045-1053.
作者姓名:孙爱清  张杰道  万勇善  刘风珍  张昆  孙利
作者单位:1 山东农业大学农学院 / 作物生物学国家重点实验室 / 山东省作物生物学重点实验室, 山东泰安 271018; 2 山东农业大学生命科学学院, 山东泰安 271018
基金项目:国家现代农业产业技术体系建设专项,国家自然科学基金项目,山东省自然科学基金项目
摘    要:以抗旱性强的花生品种丰花5号为材料,利用Solexa高通量测序技术对15% PEG处理后的花生叶片cDNA文库进行差异基因表达谱分析。结果表明,转录组基因表达表现出高度的不均一性和冗余性,低于10个拷贝的标签占总标签种类的73.1%,但其表达量只占总标签表达量的9.0%。根据已知序列信息鉴定出935个差异表达基因,其中64.5%下调表达。基因功能分析表明,差异表达基因广泛涉及糖、蛋白、核酸和脂类等生物大分子代谢、能量代谢以及次生代谢过程。在花生干旱响应基因表达谱分析中,发现9个类黄酮代谢相关基因在干旱胁迫下显著上调表达,其中4个编码类黄酮合成酶类,3个编码甲基转移酶,2个编码MYB转录因子。通过半定量RT-PCR对花生苯丙氨酸解氨酶基因(AhPAL)表达分析表明,15%PEG干旱胁迫6 h诱导该基因显著表达。推测类黄酮代谢在花生干旱胁迫响应中起重要作用。

关 键 词:花生  干旱  高通量测序  基因表达谱
收稿时间:2012-07-06

In silico Expression Profile of Genes in Response to Drought in Peanut
SUN Ai-Qing , ZHANG Jie-Dao , WAN Yong-Shan , LIU Feng-Zhen , ZHANG Kun , SUN Li.In silico Expression Profile of Genes in Response to Drought in Peanut[J].Acta Agronomica Sinica,2013,39(6):1045-1053.
Authors:SUN Ai-Qing  ZHANG Jie-Dao  WAN Yong-Shan  LIU Feng-Zhen  ZHANG Kun  SUN Li
Institution:1.State Key Laboratory of Crop Biology / Shandong Key Laboratory of Crop Biology / College of Agriculture, Shandong Agricultural University, Tai’an 271018, China;2.College of Life Sciences, Shandong Agricultural University, Tai’an 271018, China
Abstract:
Keywords:Peanut  Drought  High-throughput sequencing  Gene expression profile
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