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水稻黑条矮缩病毒和水稻条纹叶枯病毒侵染下水稻qRT\|PCR内参基因的筛选
引用本文:沈江锋,李俊敏,孙丽英,陈剑平.水稻黑条矮缩病毒和水稻条纹叶枯病毒侵染下水稻qRT\|PCR内参基因的筛选[J].植物病理学报,2014,44(3):276-286.
作者姓名:沈江锋  李俊敏  孙丽英  陈剑平
作者单位:浙江师范大学化学与生命科学学院,金华 321004;
浙江省农业科学院病毒学与生物技术研究所,杭州 310021
基金项目:国家自然科学基金(31071660);973 项目(2010CB126203,2012CB722504);国际科技合作项目 (2012DFA30900)
摘    要: 病毒侵染通常会干扰寄主细胞的生理代谢过程,分析病毒侵染后寄主基因的表达差异,将为病毒与寄主之间的互作研究提供重要的分子基础。实时荧光定量PCR(qRT\|PCR)是目前基因表达分析中应用最广泛的方法之一,选择合适的内参基因对实验进行校正和标准化至关重要。但是,一些常用作内参的看家基因会受到病毒侵染的影响。本研究中,以感染水稻黑条矮缩病毒(Rice black\|streaked dwarf virus,RBSDV)和水稻条纹叶枯病毒(Rice stripe virus,RSV)的水稻总RNA为材料,利用qRT\|PCR技术和3个统计学软件探讨了10个常用内参基因在病毒侵染下的稳定性。结果显示,感染RBSDV和RSV水稻中表达最稳定的都是UBC和β\|TUB。因此,可选用UBCβ\|TUB组合作为分析RBSDV和RSV侵染过程的水稻内参基因。

关 键 词:水稻  RBSDV  RSV  qRT\  PCR  内参基因  

Reference gene selection for real\|time fluorescence quantitative PCR analysis in rice plants infected by Rice black\|streaked dwarf virus or Rice stripe virus
SHEN Jiang\|feng,LI Jun\|min,SUN Li\|ying,CHEN Jian\|ping.Reference gene selection for real\|time fluorescence quantitative PCR analysis in rice plants infected by Rice black\|streaked dwarf virus or Rice stripe virus[J].Acta Phytopathologica Sinica,2014,44(3):276-286.
Authors:SHEN Jiang\|feng  LI Jun\|min  SUN Li\|ying  CHEN Jian\|ping
Institution:College of Chemistry and Life Science, Zhejiang Normal University, Jinhua 321004, China;
Institute of Virology and Biotechnology, Zhejiang Academy of Agricultural Sciences, Hangzhou 310021, China
Abstract:
Keywords:rice  RBSDV  RSV  qRT\  RCR  reference gene
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