| 大豆GmIDD及其同源基因的生物信息学分析及功能预测 |
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| 引用本文： | 杨雪,王阔,李英华,郑艳红,姚愈恒,李敏敏,赵琳,李文滨. 大豆GmIDD及其同源基因的生物信息学分析及功能预测[J]. 大豆科学, 2017, 36(4). DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2017.04.0525 |
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| 作者姓名： | 杨雪 王阔 李英华 郑艳红 姚愈恒 李敏敏 赵琳 李文滨 |
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| 作者单位： | 东北农业大学大豆研究所/大豆生物学教育部重点实验室,黑龙江哈尔滨,150030 |
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| 基金项目： | 黑龙江省普通本科高等学校青年创新人才培养计划，国家重点研发计划“七大农作物育种”重点专项，转基因生物新品种培育科技重大专项，黑龙江省自然科学基金，东北农业大学“学术骨干”，东北农业大学2016年大学生SIPT计划，“十二五”农村领域国家科技计划课题 |
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| 摘 要： | 利用NCBI和Phytozome数据库进行GmIDD基因的同源基因检索,获取该基因在大豆不同染色体中5个拷贝的序列信息。通过对功能结构域的分析结果显示GmIDD基因5个拷贝均含有2个C2H2型(72~92 aa、114~142 aa)、2个C2HC型(149~169 aa、176~195 aa)锌指结构域。GmIDD基因cDNA序列全长为1 227 bp,编码408个氨基酸。系统进化树分析结果显示GmIDD基因5个拷贝中除了Glyma.14g10940和Glyma.17G228000外,其它IDD蛋白间进化距离较远,表明不同大豆IDD基因在功能上可能存在一定差异。长短日照处理下GmIDD表达量的分析结果显示GmIDD基因受短日照诱导表达,因此推测GmIDD可能参与大豆开花的调控过程。
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| 关 键 词： | 大豆 GmIDD基因 锌指结构域 短日照 |
Bioinformatics Analysis and Functional Prediction of Soybean GmIDD and Its Homologous Genes |
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| YANG Xue,WANG Kuo,LI Ying-hua,ZHENG Yan-hong,YAO Yu-heng,LI Min-min,ZHAO Lin,LI Win-bin. Bioinformatics Analysis and Functional Prediction of Soybean GmIDD and Its Homologous Genes[J]. Soybean Science, 2017, 36(4). DOI: 10.11861/j.issn.1000-9841.2017.04.0525 |
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| Authors: | YANG Xue WANG Kuo LI Ying-hua ZHENG Yan-hong YAO Yu-heng LI Min-min ZHAO Lin LI Win-bin |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Soybean GmIDD Zinc finger domain Short days |
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