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作物生长模型分布式并行调度方案的比较
引用本文:姜海燕,尹 言,彭川阳,汤 亮,曹卫星. 作物生长模型分布式并行调度方案的比较[J]. 农业工程学报, 2011, 27(6): 237-243. DOI: 10.3969/j.issn.1002-6819.2011.06.043
作者姓名:姜海燕  尹 言  彭川阳  汤 亮  曹卫星
作者单位:1. 南京农业大学信息科技学院,南京210095;南京农业大学江苏省信息农业高技术研究重点实验室,南京210095
2. 南京农业大学信息科技学院,南京,210095
3. 南京农业大学江苏省信息农业高技术研究重点实验室,南京,210095
基金项目:国家自然科学基金资助(30971697);江苏省科技支撑计划资助(BE2009342);国家大学生创新计划(GJ0835)
摘    要:为了提高作物生长模型的计算速度,论文提出了多种分布式并行调度方案。综合分析了田块尺度下作物生长子模型以及子模型内部组分的数据依赖关系和计算流程。以流水线技术和分治策略为基础,分别在模型组分层、子模型层和驱动数据层设计了不同的分布式并行调度方案。在WCCS2003(Windows Compute Cluster Server 2003)组成的PC集群环境下,分别采用了OpenMP、MPI_OpenMP混合以及MPI编程模型实现了多种调度方案的并行模拟。并行加速比的实验分析表明,优化后的子模型层并行调度方案,在6个双核CPUs组成的PC集群上的平均加速比可达到8.2,更接近模型并行计算加速比的预测值。在分布式集群环境下,采用基于MPI的子模型层中等粒度的并行调度方案具有更快的计算速度,更适合于作物生长模拟系统。

关 键 词:作物,并行算法,消息传递,生长模拟模型,集群,共享内存
收稿时间:2010-10-10
修稿时间:2011-05-09

Comparison of distributed parallel scheduling schemes for crop growth model
Jiang Haiyan,Yin Yan,Peng Chuanyang,Tang Liang and Cao Weixing. Comparison of distributed parallel scheduling schemes for crop growth model[J]. Transactions of the Chinese Society of Agricultural Engineering, 2011, 27(6): 237-243. DOI: 10.3969/j.issn.1002-6819.2011.06.043
Authors:Jiang Haiyan  Yin Yan  Peng Chuanyang  Tang Liang  Cao Weixing
Affiliation:Jiang Haiyan1,2,Yin Yan1,Peng Chuanyang1,Tang Liang2,Cao Weixing2 (1.College of Information Science and Technology,Nanjing Agricultural University,Nanjing 210095,China,2.Key Lab of Information Agriculture of Jiangsu Province,China)
Abstract:
Keywords:crops   parallel algorithms   message passing   growth simulation model   cluster   sharing memory
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