| 类乌齐牦牛全基因组RNA编辑位点预测及剖析 |
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| 引用本文： | 王嘉博,舒涛,柴志欣,王吉坤,王会,武志娟,唐友,钟金城,姬秋梅.类乌齐牦牛全基因组RNA编辑位点预测及剖析[J].畜牧兽医学报,2021,52(1):88-97. |
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| 作者姓名： | 王嘉博 舒涛 柴志欣 王吉坤 王会 武志娟 唐友 钟金城 姬秋梅 |
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| 作者单位： | 1. 西南民族大学 青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省、教育部重点实验室, 成都 610041;2. 吉林农业科技学院, 长春 132309;3. 大麦、牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室, 拉萨 850000 |
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| 基金项目： | 国家肉牛牦牛产业技术体系建设项目(CARS-37);中央高校基本科研业务费专项基金项目(2020NQN26)。 |
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| 摘 要： | 为揭示牦牛不同组织间受RNA编辑导致转录产物发生的差异变化，进而为牦牛的组织分化、系统遗传调控等研究提供候选基因。本研究以3头4.5岁类乌齐母牦牛的大脑、小脑、臀部脂肪以及肌肉组织作为试验材料，通过Illumina 4000测序平台对各组织表达产物进行扫描，利用SPRINT和JACUSA筛选差异的RNA编辑位点，分析RNA编辑位点的分类、注释以及变异风险评估等。结果发现了总计24 784个RNA编辑位点，其中在4个组织中均发现存在编辑事件的有4 015个位点；4个组织中的RNA编辑位点主要以A-G和T-C编辑类型为主；发现其中一个高风险编辑位点位于SON基因中，使该基因的翻译提前终止，这将导致该组织一些特定位点的RNA与DNA结合出现问题。本研究预测并分析了类乌齐牦牛大、小脑和臀部肌肉、脂肪组织中RNA编辑差异位点的类型和分布，为进一步研究牦牛组织分化和生长发育中重要的调控基因提供了新的参考。
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| 关 键 词： | 类乌齐牦牛 RNA编辑位点 SPRINT JACUSA |
| 收稿时间： | 2020-06-09 |
Prediction and Analysis of RNA Editing Sites in the Whole Genome of Leiwuqi Yaks |
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| WANG Jiabo,SHU Tao,CHAI Zhixin,WANG Jikun,WANG Hui,WU Zhijuan,TANG You,ZHONG Jincheng,JI Qiumei.Prediction and Analysis of RNA Editing Sites in the Whole Genome of Leiwuqi Yaks[J].Acta Veterinaria et Zootechnica Sinica,2021,52(1):88-97. |
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| Authors: | WANG Jiabo SHU Tao CHAI Zhixin WANG Jikun WANG Hui WU Zhijuan TANG You ZHONG Jincheng JI Qiumei |
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| Institution: | 1. Key Laboratory of Qinghai-Tibetan Plateau Animal Genetic Resource Reservation and Utilization of Sichuan and Ministry of Education, Southwest Minzu University, Chengdu 610041, China;2. Jilin Agricultural Science and Technology University, Changchun 132309, China;3. State Key Laboratory of Hulless Barley and Yak Germplasm Resources and Genetic Improvement, Lhasa 850000, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Leiwuqi yaks RNA editing site SPRINT JACUSA |
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