杜鹃花RsSnRK基因家族鉴定及表达分析

为探究杜鹃花(Rhododendron simsii )蔗糖非酵解Ⅰ型相关蛋白激酶(sucrose non-fermenting-1-related protein kinase,SnRK)对非生物胁迫的响应,基于杜鹃花基因组数据,利用生物信息学方法对RsSnRKs进行筛选鉴定和分析,并运用实时荧光定量PCR技术 (RT-qPCR) 检测该家族基因对干旱胁迫的响应情况。结果鉴定出杜鹃花RsSnRK基因家族共有3个亚族19个成员,它们编码的蛋白均为亲水蛋白,长度为362～555氨基酸,等电点为4.80～9.27,相对分子质量为41 025. 65～62 951.44 Da,二级结构以α-螺旋和不规则卷曲为主,预测其主要位于细胞核或细胞质中。Motif和顺式作用元件分析发现,RsSnRKs同一亚家族基因具有相似的结构和基序,且RsSnRKs上游2 000 bp含大量的光响应、激素响应和非生物胁迫响应等元件。共线性分析发现,杜鹃花RsSnRK2/RsSnRK14在内的4组共线性对基因进化选择压力值均小于1,受纯化选择;此外,10个RsSnRKs与15个拟南芥AtSnRKs存在19条共线性关系。RT-qPCR分析发现,杜鹃花RsSnRK第Ⅱ亚家族成员RsSnRK7、RsSnRK9和RsSnRK13的相对表达量随着干旱程度加重而明显上调,复水后又显著下调表达,说明杜鹃花RsSnRKs能够积极响应干旱胁迫。结果为进一步探索杜鹃花RsSnRKs基因功能奠定基础,并为杜鹃花抗旱基因的筛选提供理论依据。