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粘虫核糖体蛋白S11基因cDNA的克隆和序列分析
引用本文:李 柯,阴 环,廉振民. 粘虫核糖体蛋白S11基因cDNA的克隆和序列分析[J]. 西北农林科技大学学报(自然科学版), 2010, 38(4): 171-175
作者姓名:李 柯  阴 环  廉振民
作者单位:陕西师范大学生命科学学院;山西师范大学生命科学学院;延安大学生命科学学院;
基金项目:教育部科学技术研究重点项目(206148); 陕西省教育厅科研计划项目(06JK156)
摘    要:【目的】克隆和鉴定粘虫核糖体蛋白S11(Ribosomal Protein S11,RPS11)基因,为昆虫核糖体蛋白功能的研究提供基础资料。【方法】运用RT-PCR和RACE技术,以粘虫cDNA为模板,对RPS11基因进行克隆,获得其全长cDNA序列,并利用生物信息学方法,对RPS11基因全长cDNA序列及推测得到的RPS11蛋白氨基酸序列进行分析,构建其系统进化树。【结果】获得的粘虫核糖体蛋白S11基因(RPS11)cDNA序列长度为521 bp,其中包括26 bp的5′非编码区、36 bp的3′非编码区和459 bp的开放阅读框,编码一个由152个氨基酸组成的蛋白,其具有核糖蛋白S17蛋白家族典型特征。推测得到的粘虫RPS11蛋白的理论分子质量为17.737 9 ku,等电点为10.63,富含6种类型的特定功能位点,与同属夜蛾科的烟芽夜蛾(Heliothis virescens)的RPS11蛋白相似性高达97%。用Neigh-bor-joining(NJ)法构建基于RPS11氨基酸序列的系统发育树,结果显示,粘虫RPS11与烟芽夜蛾(H.virescens)、草地贪夜蛾(Spodoptera frugiperda)和家蚕(Bombyx mori)等3种鳞翅目昆虫的亲缘关系较近。【结论】成功获得了粘虫RPS11基因全长序列(GenBank登录号为GQ222274),由其编码的核糖体蛋白RPS11属于核糖蛋白S17蛋白家族。

关 键 词:粘虫  核糖体蛋白S11基因  克隆
收稿时间:2009-10-17

Cloning and sequence analysis of a ribosomal protein S11 gene in the oriental armyworm,Mythimna separata (Walker)
LI Ke,,YIN Huan,LIAN Zhen-min,,XI Geng-si. Cloning and sequence analysis of a ribosomal protein S11 gene in the oriental armyworm,Mythimna separata (Walker)[J]. Journal of Northwest A&F University(Natural Science Edition), 2010, 38(4): 171-175
Authors:LI Ke    YIN Huan  LIAN Zhen-min    XI Geng-si
Affiliation:LI Ke1,2,YIN Huan1,LIAN Zhen-min1,3,XI Geng-si1(1 College of Life Sciences,Shaanxi Normal University,Xi'an,Shaanxi 710062,China,2 College of Life Sciences,Shanxi Normal University,Linfen,Shanxi 041004,3 College of Life Sciences,Yanan University,Yanan,Shaanxi 716000,China)
Abstract:
Keywords:Mythimna separata(Walker)  RPS11  cloning  
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