百合斑驳病毒靖宇分离物全基因组序列测定与进化分析 |
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引用本文: | 张春雨,李小宇,王晨,黄瑞贤,黄淑敏,王永志.百合斑驳病毒靖宇分离物全基因组序列测定与进化分析[J].北方园艺,2023(24):59-64. |
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作者姓名: | 张春雨 李小宇 王晨 黄瑞贤 黄淑敏 王永志 |
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作者单位: | 1. 吉林省农业科学院(中国农业科技东北创新中心)植物保护研究所;2. 靖宇县农业技术推广中心 |
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摘 要: | 以采自吉林省白山市靖宇县的野生百合感病叶片为试材,采用小RNA深度测序法检测到1株百合斑驳病毒(Lily mottle virus,LMoV),采用分段克隆方法,对LMoV靖宇分离物(LMoV-JY)的全基因组进行测定并分析,以期对吉林省百合病毒病的检测和防控提供参考依据。结果表明:LMoV-JY基因组大小为9 648个核苷酸(nt)序列(GenBank登录号MT795719),该核苷酸序列在第154~9 444位存在1个大的开放阅读框(ORF),编码1个多聚蛋白(分子量351.46 kD)。LMoV-JY与GenBank中登录的其他LMoV分离物的全基因组核苷酸序列比较,其一致性为82.82%~97.85%,在氨基酸水平上的一致性为92.96%~98.64%,其中与百合斑驳病毒大连分离物LMoV-DL(HM222521)的一致性在该2种水平上均为最高。对比LMoV-JY外壳蛋白与其他54个分离物的氨基酸序列,发现可将LMoV分离物分为2个类群。
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关 键 词: | 百合斑驳病毒 基因组 |
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