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基于全基因组重测序的现代马群体遗传结构和选择信号分析
作者姓名:徐媛  徐继平  刘小英  姜雨
作者单位:(1.西北农林科技大学 动物科技学院,陕西杨凌 712100;2.榆林市榆阳区 补浪河区域畜牧兽医工作站,陕西榆林 719000)
摘    要:本研究基于全基因组重测序数据,以全球76个马品种共406匹马为研究对象,采用主成分分析、系统发育树和祖先成分分析三种方法,在遗传学层面综合评估了现代马群体的遗传结构。此外,以核苷酸多样性为指标对现代马群体的遗传多样性进行了评估,并运用Fst和XP EHH受选择方法检测不同马群体之间的基因组选择信号,筛选出了5个与藏马高原适应性显著相关的候选基因(HBB、EPAS1、TMEM247、RHOQATP6V1E2),3个与中国西南马体型性状显著相关的候选基因(HMGA2、TBX3TBX5),以及与欧美高度选育马的马术表演,行为和运动显著相关的基因(IGFBP3、IGFBP1、HSD7AADCY1)。该研究为进一步保护地方马种的种质资源提供科学依据,并揭示人工培育马种的选择方向。

关 键 词:全基因组重测序  群体结构  选择信号分析  候选基因
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