利用基因组重测序技术鉴定彭阳县夏洛莱牛的纯度

［目的］对宁夏彭阳县10头夏洛莱牛进行全基因组重测序,并与下载的48头牛的全基因组重测序数据进行比对分析,以鉴定彭阳县10头夏洛莱牛的纯度。［方法］利用全基因组重测序技术和生物信息学分析方法。［结果］通过对彭阳县10头夏洛莱牛全基因组数据进行分析,共检测到17,583,444个SNP位点,其基因组的核苷酸多样性（0.0016）稍微高于欧洲普通牛（0.0012）和东亚普通牛（0.0011）。遗传结构分析表明,当K=3时,10头彭阳县夏洛莱牛主要为欧洲普通牛血统（64.10% ~ 95.54%）,其次是东亚普通牛血统（0.00% ~ 32.25%）和中国瘤牛血统（3.09% ~ 13.51%）,说明彭阳县10头夏洛莱牛都存在不同程度的东亚普通牛和中国瘤牛血统。［结论］基于全基因组重测序分析,彭阳县10头夏洛莱牛均为杂交牛。