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黄瓜、西瓜和南瓜EIN3基因片段的克隆与序列分析
引用本文:陈惠明,卢向阳,许亮,许勇,张海英,刘晓虹.黄瓜、西瓜和南瓜EIN3基因片段的克隆与序列分析[J].农业生物技术学报,2007,15(4):668-672.
作者姓名:陈惠明  卢向阳  许亮  许勇  张海英  刘晓虹
作者单位:1. 湖南省蔬菜研究所,湖南省蔬菜工程与技术研究中心,长沙,410125;湖南农业大学生化与发酵工程实验室,长沙,410128
2. 湖南农业大学生化与发酵工程实验室,长沙,410128
3. 国家蔬菜工程技术研究中心,北京,100089
4. 湖南省蔬菜研究所,湖南省蔬菜工程与技术研究中心,长沙,410125
基金项目:国家高技术研究发展计划(863计划)
摘    要:EIN3(ethylene insensitive 3)位于细胞核的核蛋白,为乙烯信号转导的下游调控基因,根据GenBank植物EIN3基因家族的保守序列设计了1对引物,以黄瓜(Cucumis sativus)、西瓜(Citrullus lanatus)和南瓜(Cucurbita maxima)总DNA为模板PCR扩增到3个725bp的基因片段CsEIN3、ClEIN3和CmEIN3,并提交GenBank,登录号分别为AY973275、DQ023225和DQ023224。将片段序列在NCBI数据库中Blastn同源搜寻,显示151条有同源性的序列全部是EIN3基因。NCBI网站的ORF(open reading frame)Finder找到正确的开放式阅读框,翻译成为氨基酸序列,对CsEIN3、ClEIN3及CmEIN3氨基酸序列在NCBI网站进行Blastp比对,在大分子结构数据库(molecular modelling database,MMDB)搜索,3个推测蛋白保守结构域三级结构与拟南芥EIN3的DNA结合域(MMDB:30598;PDB:1WIJ)完全相同,系统进化分析表明,黄瓜、西瓜和南瓜与双子叶植物甜瓜、绿豆、蒺藜状苜蓿、烟草、番茄、拟南芥及单子叶水稻、桃红蝴蝶兰等的EIN3家族成员都有较高的相似性。

关 键 词:基因克隆  黄瓜  西瓜  南瓜
文章编号:1006-1304(2007)04-0668-05
收稿时间:2006-09-15
修稿时间:2006-10-20

Cloning and Sequence of EIN3 Gene from Cucumis sativus, Citrullus lanatus and Cucurbita maxima
CHEN Hui-ming,LU Xiang-yang,XU Liang,XU Yong,ZHANG Hai-ying,LIU Xiao-hong.Cloning and Sequence of EIN3 Gene from Cucumis sativus, Citrullus lanatus and Cucurbita maxima[J].Journal of Agricultural Biotechnology,2007,15(4):668-672.
Authors:CHEN Hui-ming  LU Xiang-yang  XU Liang  XU Yong  ZHANG Hai-ying  LIU Xiao-hong
Abstract:
Keywords:EIN3
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