| 植物抗寒转录激活因子ICE1和ICE2基因的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 蒋瑶,陈文波,周泽斯,陈其兵.植物抗寒转录激活因子ICE1和ICE2基因的生物信息学分析[J].贵州农业科学,2015(3):24-30. |
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| 作者姓名： | 蒋瑶 陈文波 周泽斯 陈其兵 |
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| 作者单位： | 1. 凯里学院 环境与生命科学学院,贵州 凯里,556011
2. 四川农业大学 风景园林学院,四川 成都,611130 |
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| 基金项目： | 贵州省教育厅优秀科研创新团队项目“黔东南生物多样性保护和利用创新团队”[黔教合人才团队字(2013)26]；凯里学院博士启动基金项目“黔东南州野生百合高效离体培养及理化分析” |
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| 摘 要： | 从美国在线数据库(NCBI)中获得不同植物ICE1和ICE2基因的完整序列并对其进行分析,以期对ICE基因的结构与生物学功能研究提供理论基础。利用Clustal W2和Mega 5.0软件对其基因的氨基酸序列进行多重比对和系统发育树构建,并采用不同的生物信息手段对其蛋白的一、二、三级结构进行分析。结果表明:ICE1和ICE2基因均含有4个不同的结构域,即富S区、核定位信号区(NLS)、bHLH结构域和转膜区,但其bHLH结构域和富S区(单子叶植物间)存在差异。ICE1和ICE2基因编码的氨基酸主要是脂肪族类氨基酸,以丝氨酸(Ser)和亮氨酸(Leu)为主,其等电点均呈酸性,等电点值均是单子叶双子叶,ICE1和ICE2均为亲水性不稳定蛋白。C和H为ICE1和ICE2蛋白二级结构的主要元件,E和T只是零星分布在整个蛋白中,且H、T、E、C的含量均存在差异,其含量及折叠方式的差异导致蛋白三级结构的不同。ICE1和ICE2基因在基因序列上有相似的结构域,但其蛋白结构存在差异。
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| 关 键 词： | ICE1 ICE2 生物信息学 |
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